在古老的不列颠曆史上有一位偉大國王叫亞瑟王,他們國家在面臨滅亡時,梅林法師用外星人變形金剛給他的權杖,召喚出三頭鐵甲噴火飛龍擊退敵人,這把權杖擁有強大的能量,甚至可以挽救星球的命運，贈與他權杖的變形金剛叮囑,千萬不要讓其他人得到它 那樣會招來災難.之後亞瑟王獲得了勝利而被後人們津津樂道。
噴火龍攻擊不敵人
來到1600年之後 ，變形金剛與人類無法共同生存 ，人類害怕政權遭到變形金剛的威脅 是以驅逐囚禁這些，外來的生命，霸天虎的隊員們被人類關押着威震天卻消失不見，汽車人的隊員每天東躲西藏而擎天柱也音信全無，地球上此刻成立了變形金剛反應部隊，他們在政權的指揮下專門獵捕殺害變形金剛，來維護自己統治地球的絕對地位。最近一直不斷有外星變形金剛降臨地球導緻混亂，他們把這些外星生命全部消滅仍在一處機器人墳場。
附近淘氣的孩子好奇這些鋼鐵巨人過來湊熱鬧，結果被政府的機器人守衛發現就要崩了幾個淘氣的娃娃，好奇心差點害死幾個熊孩子，而一位勇敢的小姑娘出現很麻利的放到了機器人守衛，救了幾個熊孩子，可見男孩成熟的要比女孩晚很多，不同環境成長的孩子心智也不一樣，這個小女孩從小在機器人戰争中失去父母，獨自生存到現在她的自立能力非常強，接下來更危險的事情到來，男主凱德出現拯救了他們，凱德出現解救了一群淘氣的娃娃，不畏政府強權一心幫助汽車人的凱德被古老的變形金剛認可，并且獲得了一塊護符據說他擁有護主的能力。
回到自己的汽車垃圾場，這裡的汽車人差不多快要鬧翻天了，長期躲避政府軍隊的搜查和圍剿汽車人很難過，而凱德一直在這裡偷偷的保護汽車人，此時汽車人的首領擎天柱已經消失很久去了母星賽博坦，而狂派霸天虎的首領威震天也蹤迹全無，平靜下隐藏着一場更大危機的到來，突然威整天重新出現并且從政府那裡帶走自己的成員，他被賽博坦星球自稱是造物者的昆塔莎控制，到地球尋找曾經梅林獲得那把變形金剛給他的權杖，威整天的霸天虎團隊來到汽車墳場找汽車人和凱德麻煩。
汽車人和凱德以及他們所有人開始逃跑，他們跑到一處荒廢的場地時被發現蹤迹，霸天虎與汽車人開始戰鬥，汽車人的陣營中有一條變形金剛騎士幻化的三頭鐵甲噴火龍，它與大黃蜂一衆汽車人配合打退了威整天的霸天虎團隊，霸天虎退走後武裝部隊的人繼續追殺凱德，放出了大量的無人機攻擊凱德這些人，無人機中有一隻指揮機如果能消滅它就能擺脫攻擊，在一連串的驚險過程中他們遇到了一位會功夫的機器人，他是一位古老的機器人管家被主人派來迎接他們，但是此時凱德被突然出現的無人機攻擊，最後他巧合下跳到了領頭的無人機上把它消滅了，之後被會功夫的機器人帶到了英格蘭一座古老的城堡。
同時來到這裡的還有一位女主薇薇安，城堡的主人是一位伯爵，他們家曆代以來都以守護變形金剛的秘密為職責，這一次召喚他們到來是因為賽博坦星球正在向地球移動，很快就要撞到地球 地球将面臨毀滅，凱德因為獲得護符的認可說明他身上具有騎士精神，騎士在這場戰争中将發揮着重大的作用，薇薇安是1000多年前法師梅林的後裔，梅林死後把權杖藏了起來隻有他的後裔才知道地點，并且隻有梅林的後裔能使用權杖，而權杖是阻止賽博坦星球來毀滅地球的唯一辦法。
而擎天柱這時卻回到自己的母星賽博坦，發現那裡破敗不堪即将滅亡，卻在這裡發現了一位叫昆塔莎自稱是變形金剛的創造者，她說想要賽博坦恢複生機必須通過權杖，吸收地球的能源才能重建賽博坦，權杖在一千多年前被十二位騎士他們給偷走後藏在地球，是以現在要到地球找到權杖通過它吞噬掉地球重建賽博坦，昆塔莎的能力十分強大擎天柱不是對手，并且被洗腦成功為昆塔莎尋找權杖重建自己的家園。
地球上在伯爵的指點下薇薇安和凱德找到了權杖的藏地，是深海中一處外星飛船裡那裡是梅林的募穴，權杖就藏在梅林的棺材當中，當他們找到時卻被趕來被迷惑的擎天柱奪走權杖，凱德感覺很熟悉的擎天柱變得很陌生，就讓大黃蜂阻止他，大黃蜂在打鬥中重新喚醒了汽車人首領擎天柱
而卻被趕到的威震天打倒奪走了權杖交給造物主昆塔莎，趕來的變形金剛騎士要殺死背叛賽博坦的擎天柱時，凱德激活了護符變化騎士長劍也喚醒了被蠱惑的變形金剛騎士，這些騎士本來有十二位，圓桌騎士的由來就是當年12位變形金剛在亞瑟王那裡提出的，變形金剛騎士們他們忠誠于正義而非個人打算共同對抗昆塔莎，地球上神秘的巨石陣就是地球能量的入口，在這裡賽博坦降臨昆塔莎開啟了權杖開始吸收能量，兩方機器人開始大戰人類也參與到其中，卻由于昆塔莎的手下火力強大他們無法攻進去奪回權杖，人類的政權首腦下令士兵撤退動用超級武器毀掉賽博坦 ，雖然炸碎了賽博坦一部分但吸收地球能源的運作沒有停止，這個辦法根本不起作用。
還是汽車人幫助凱德與微微安成功的進入了昆塔莎的領域，擎天柱打敗了威震天就去尋找昆塔莎，昆塔莎的能力很強可以禁锢變形金剛無法移動，被控制的擎天柱其實早已經和大黃蜂默契的配合好，大黃蜂背後補刀擊退了昆塔莎可是昆塔莎消失不見了，薇薇安成功的拔下了權杖後賽博坦停止吸收地球的能量，一場危機被男主與女主在汽車人的配合下化解了。
大家平安無恙凱德收獲了薇薇安的愛情，賽博坦此時與地球合二為一，擎天柱呼叫所有汽車人重建家園，而在荒蕪的沙漠中卻走出一位女人，他就是沒有死掉自稱造物主的昆塔莎，幻化成人繼續謀劃她邪惡的計劃。