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小夥伴們，大家好呀，很高興和大家見面，最近看到有果粉提問關于WGCNA分析中的module-trait-realtionship圖譜的問題，之前呢有寫過關于WGCNA分析中的一些專業術語基礎知識的推文，如果有小夥伴需要，可直接在往期裡面查找就可以了，今天呢我們來聊聊關于如何進行module-trait-realtionship讀圖。内容分為兩部分：
一是介紹什麼是module，
二是module-trait-realtionship圖解讀。
走神的，還沒有準備好的小夥伴快來看這吧。
一介紹Module
Module：稱為子產品，也可以把它看為一個是基因集。在子產品記憶體在高度相關的基因。在WGCNA分析中把基因聚類成子產品後，對每個子產品進行了功能富集分析、子產品與性狀進行關聯分析和子產品與樣本進行關聯分析，分别可以去查找基因的功能特征，篩選出表型與性狀關聯較高的的子產品和查找樣本中特異表達基因。
二解讀module-trait realtionship圖譜
module-trait-realtionship圖譜是像上圖這樣的，它是子產品與表型特征關聯圖譜。首先我們來看橫坐标：它是表型性狀（trait），這裡呢它有兩個表型性狀，一個是Healthy，另一個是Heart_failure。縱坐标：對應子產品，用每個子產品的特征基因（eigengene）來表示這個子產品。eigengene代表的是每個子產品的第一主成分。
在本圖中有9個子產品，分别用不同顔色表示。格子代表橫坐标的表型性狀和縱坐标的每個子產品的相關性以及pvalue值，紅色越深，越正相關；綠色越深，越負相關。最右邊的圖例，代表的是相關性，越接近1紅色越深，代表正相關，越接近-1綠色越深，代表負相關。根據上圖可以看出分析得到的9個子產品中，有5個子產品（MEturquoise、MEpink、MEblack、MEbrown、MEblue）與疾病的相關性較高（|r|>0.7,p<0.05）。
到這裡呢，小果的分享就到此結束了，小夥伴有什麼問題可以私信小果，期待與小夥伴再會。
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