參考：
獨占鳌頭的Illumina儀器(二代測序篇)
HiSeq2000測序原理、流程與儀器
NGS文庫制備的方法比較[心得點評]
各種測序文庫建構方式
樣本：就是待測的DNA、RNA或蛋白序列，樣本來源單一的就是單樣本，樣本來源于多處就是多樣本，一般我們測序用的樣本都是單樣本，但有時候有特殊需求，我們會把一些樣本混合在一起測序，也就是多樣本測序。
文庫：二代三代讀長都是有限的，為此我們必須将全長的序列打斷成小片段的文庫才能進行測序。總的來說，在NGS分析之前，制備RNA或DNA的主要步驟包括：片段化和/或篩分指定長度的目标序列；将目标片段轉化成雙鍊DNA；在片段末端連上寡核苷酸接頭；以及定量最終的文庫。
單端測序和雙端測序：單端測序(Single-read)首先将DNA樣本進行片段化處理形成200-500bp的片段，引物序列連接配接到DNA片段的一端，然後末端加上接頭，将片段固定在flow cell上生成DNA簇，上機測序單端讀取序列(圖1)。 Paired-end方法是指在建構待測DNA文庫時在兩端的接頭上都加上測序引物結合位點，在第一輪測序完成後，去除第一輪測序的模闆鍊，用對讀測序子產品(Paired-End Module)引導互補鍊在原位置再生和擴增，以達到第二輪測序所用的模闆量，進行第二輪互補鍊的合成測序(圖2)。
flowcell：FC，一個FC就是一個載玻片狀的載體，它是測序的場所。
lane：表示測序晶片上的一條流通槽,測序文庫與試劑均在裡面,測序信号的掃描也是按照一條lane上的一個tile進行。一個FC有多條lane，一般是8條
run：測序儀運作一次
把上面4篇文章看完基本就能了解二代測序的原理了~
