GEO 資料介紹及線上下載下傳

下載下傳資料之前你要了解GEO資料庫的4個概念和4個資料存放類型：

GSE資料編号(Series)

GPL資料編号(GEO platforms)

GSM資料編号(Samples)

GDS資料編号(Datasets)

一篇文章可以有一個或者多個GSE(Series)資料集，一個GSE裡面可以有一個或者多個GSM(Samples)樣本，而每個資料集都有着自己對應的晶片平台，就是GPL(GEO

platforms)。GSE編号一般為作者送出時生成的原始資料編号，後續NCBI中的從業人員會根據研究目的、樣品類型等資訊歸納整合為一個GDS(Datasets)，整理後的資料還會有GEO

profile資料，也就是基因在這次實驗中的表達資料。GDS裡面的資料往往對應相同的平台具有可比性，另外，不是所有的GSE資料都能被整理，是以，有的GSE資料裡面沒有GDS資料也是正常。

https://zhuanlan.zhihu.com/p/132559646

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