1、來源：官方VS非官方
官方與非官方的差別。黑群晖是非官方的産品，所搭載的作業系統是經第三方人員修改後用非官方的方式安裝，并未經群晖官方支援。黑群晖雖然在形式上實作了和群晖類似的功能，但是由于硬體是自己搭建，系統由未知來源的第三方提供，隐藏着巨大隐患。
2、安全性：安全可靠穩定 VS 資料損壞擔憂
一款群晖産品在設計之初做了嚴格測試，確定每一個部件都正常運作。不管是能耗控制，還是存放的空間占用率，都力求達到最優化的使用者體驗。而且群晖還為提供最及時的安全更新支援，即使是非最新版本也提供更新檔更新，讓系統時刻保持最新，達到最穩定的狀态，旨在提供安全無虞的資料存儲體驗。
然而，黑群晖安裝複雜，更新困難，功耗大、安全性低資料易丢失，反觀白群晖則是安裝、系統更新簡單容易、穩定安全可靠。而且，資料存儲安全是選擇存儲方案的根本。黑群晖雖然在形式上實作了和群晖類似的功能，但是由于硬體是自己搭建，系統由未知來源的第三方提供，資料安全上隐藏巨大憂患。
3、便捷程度：一鍵安裝 VS 重重困難的折騰
群晖NAS安裝簡單，就算是不谙IT技術的家庭使用者也可以完成系統安裝與設定——接通電源、網絡，再使用電腦根據界面訓示一步一步操作即可完成，整個安裝過程簡單友善快捷。而且當你在遇到問題時，可以直接在系統裡面、或是群晖官網送出問題給群晖技術工程師，獲得即時的服務與協助。
對比黑群晖而言，在DIY黑群晖時需要做很多準備，購買硬體進行組裝，下載下傳引導程式，制作啟動媒體等等。接下來就是準備系統安裝，安裝過程中選擇項還特别講究，選錯了就會照成安裝失敗，必須重新來過。安裝完成後還需要做更新檔，防止修改的系統不穩定造成當機。
而且，困難重重折騰的安裝隻是一個開始，安裝完成後還有漫無止境的問題。當非官方DSM系統功能出現缺失，因不是官方提供的産品，也無法獲得群晖官方技術支援。對于資料最核心的儲存設備而言，這些“困難”造成資料最核心、根本的問題——安全、穩定無法被解決。