辣椒底肥每畝可用雞糞、豬糞及各種生物菌有機肥或平衡複合肥。模式以栽培溝或栽培穴均可，建議最好用壟上覆膜栽培法，這樣有利于後期辣椒植株健壯生長，同時達到高産，好管理的作用。
農民所說的化肥二胺指的是磷酸二铵化肥，這種化肥屬于是一種高濃度的速效肥料，非常适用于辣椒植株生長和提高土壤肥力，将作基肥或追肥都是非常好的。二胺低氮高磷做底肥使用肥效期為三個月左右，辣椒種植地二胺一定要早施和深施。
二胺中氮含量不多，加上氮肥會流失、揮發，而辣椒植株對氮的需求量也比較高，若常年單一使用二胺而不補充氮肥，會造成磷過量而氮肥不足的問題。農民施用二铵作辣椒基肥應根據土壤中速效磷含量變化的情況，及時調整施肥配方，配施氮肥和鉀肥，這樣才符合平衡施肥的原則，充分發揮二胺的作用。
有不少的辣椒種植戶因土壤肥力跟不上，在種植辣椒前就配用底肥二胺與大量化肥，複合肥能用多少就用多少，用一次不夠就再多次追肥，為了保證辣椒的産量，土壤是深受其害，逐漸闆結生病失去活性，進而直接阻礙了辣椒的豐産豐收。
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