一九三四年十一月，紅25軍長征後，留下的部隊有中共皖西道委上司的第82師，第1、第2兩路遊擊師（相當于營）和鄂東北道委上司的鄂東獨立團，第3、第9兩路遊擊師，以及紅25軍的兩個連和一個手槍分隊，共近兩千人，在商城和金寨邊界、商城南部、大悟山、老君山等幾小塊遊擊根據地堅持鬥争。同年十二月，蔣介石調集十個師的兵力，在反動地方武裝的配合下，對我發動"清剿"，遊擊根據地被敵占領。
一九三五年一月，原鄂豫皖省委委員兼皖西道委書記高敬亭，在太湖縣的涼亭坳召開鄂豫皖邊區幹部會議，組成以高敬亭為書記的新的鄂豫皖省委，重新組建紅28軍，下轄第82師第244團和一個手槍團，高敬亭兼軍政治委員（未設軍長），并确定在英山、太湖、潛山、霍山一帶，建立新的遊擊根據地。紅28軍主力，依托大别山開展遊擊戰争，有力地打擊了進攻之敵。同時，皖西特委率紅28軍一部組成的第246團，在霍山、舒城、潛山一帶活動，開辟了新的根據地。鄂東北道委上司的部隊，也積極活動，重新組建了一個獨立團。
一九三五年底，蔣介石從貴州和其他地區調來的三個師，會同第11、第25路軍，再次對我發動"清剿"。紅28軍以營為機關分散活動，在山區和平原廣泛開展遊擊戰争，并抽調少量部隊加強地友善衣隊，采取襲擊、伏擊等戰術打擊敵人，經過一年的鬥争，殲滅和擊潰敵人正規軍不下十個營，遊擊區擴大到五十餘縣的範圍，紅28軍和各遊擊隊都得到很大發展。一九三七年四月，文以百集中十幾個師和三十幾個保安團，在衛立煌的指揮下，又一次對我發動"清剿"。紅28軍仍以分散活動對付敵之"清剿"。
我第244團第1營先後攻占大小集鎮三十餘個，并和手槍團一部挺進到豫南遊擊區，會同豫南遊擊隊打擊敵人。至十月，紅軍遊擊隊集中時，還儲存兩千餘人。
高敬亭居功至偉。
1939年高敬亭被冤殺。1975年11月30日，毛澤東接到高敬亭的女兒高風英請求澄清父親被害原因、作出結論的信。毛澤東訓示有關部門重新審查，在有關高敬亭的材料上批示：“我覺此案處理不當。”經中央軍委組織有關部門核查，1977年4月27日，解放軍總政治部發出《關于給高敬亭同志平反的通知》。《通知》肯定了高敬亭的功大于過的曆史，認為“将其處死是錯誤的”。
1977年4月27日,中國人民解放軍總政治部發出了《關于給高敬亭同志平反的通知》。1980年4月,高的家屬與有關部門在合肥市烈士陵園為高舉行了隆重的骨灰安放儀式。