感覺這篇文章寫的不錯，轉自http://blog.chinaunix.net/uid-677314-id-3060026.html
innodb表的資料結構
innodb這種引擎，與MYISAM引擎的差別很大。特别是它的資料存儲格式等.
對于innodb的資料結構，首先要解決兩個概念性的問題: 共享表空間以及獨占表空間。
什麼是共享表空間和獨占表空間
共享表空間以及獨占表空間都是針對資料的存儲方式而言的。
共享表空間: 某一個資料庫的所有的表資料，索引檔案全部放在一個檔案中，預設這個共享表空間的檔案路徑在data目錄下。 預設的檔案名為:ibdata1 初始化為10M。
獨占表空間: 每一個表都将會生成以獨立的檔案方式來進行存儲，每一個表都有一個.frm表描述檔案，還有一個.ibd檔案。 其中這個檔案包括了單獨一個表的資料内容以及索引内容，預設情況下它的存儲位置也是在表的位置之中。
兩者之間的優缺點
共享表空間：
優點：
可以放表空間分成多個檔案存放到各個磁盤上（表空間檔案大小不受表大小的限制，如一個表可以分布在不同步的檔案上）。資料和檔案放在一起友善管理。
缺點：
所有的資料和索引存放到一個檔案中以為着将有一個很常大的檔案，雖然可以把一個大檔案分成多個小檔案，但是多個表及索引在表空間中混合存儲，這樣對于一個表做了大量删除操作後表空間中将會有大量的空隙，特别是對于統計分析，日值系統這類應用最不适合用共享表空間。
獨立表空間：
在配置檔案（my.cnf）中設定： innodb_file_per_table
1．每個表都有自已獨立的表空間。
2．每個表的資料和索引都會存在自已的表空間中。
3．可以實作單表在不同的資料庫中移動。
4. 空間可以回收（除drop table操作處，表空不能自已回收）
a) Drop table操作自動回收表空間，如果對于統計分析或是日值表，删除大量資料後可以通過:alter table TableName engine=innodb;回縮不用的空間。
b) 對于使innodb-plugin的Innodb使用turncate table也會使空間收縮。
c) 對于使用獨立表空間的表，不管怎麼删除，表空間的碎片不會太嚴重的影響性能，而且還有機會處理。
單表增加過大，如超過100個G。
相比較之下，使用獨占表空間的效率以及性能會更高一點。
共享表空間以及獨占表空間之間的轉化
innodb_file_per_table 通過這個參數來實作的轉化，如果為OFF說明所使用的是獨占表空間【預設情況下，所使用的表空間為共享表空間】
innodb_file_per_table值來進行修改即可，但是對于之前使用過的共享表空間則不會影響，除非手動的去進行修改或者是
innodb_file_per_table=1 為使用獨占表空間
innodb_file_per_table=0 為使用共享表空間
修改獨占空表空間的資料存儲位置
innodb_data_home_dir = "C:\mysql\data\"
innodb_log_group_home_dir = "C:\mysql\data\"
innodb_data_file_path=ibdata1:10M:autoextend
innodb_file_per_table=1
參數說明:
這個設定配置一個可擴充大小的尺寸為10MB的單獨檔案，名為ibdata1。沒有給出檔案的位置，是以預設的是在MySQL的資料目錄内。【對資料來進行初始化的設定】
innodb_data_home_dir 代表為資料庫檔案所存放的目錄
innodb_log_group_home_dir 為日志存放目錄
innodb_file_per_table 是否使用共享以及獨占表空間來
以上的幾個參數必須在一起加入。
對于參數一些注意的地方
InnoDB不建立目錄，是以在啟動伺服器之前請确認”所配置的路徑目錄”的确存在。這對你配置的任何日志檔案目錄來說也是真實的。使用Unix或DOS的mkdir指令來建立任何必需的目錄。
通過把innodb_data_home_dir的值原原本本地部署到資料檔案名，并在需要的地方添加斜杠或反斜杠，InnoDB為每個資料檔案形成目錄路徑。
如果innodb_data_home_dir選項根本沒有在my.cnf中提到，預設值是“dot”目錄 ./，這意思是MySQL資料目錄。
是以在做資料的移植以及備份時，一定要注意資料檔案的完整性.