光绪三十四年十月二十一日，光绪皇帝驾崩于被圈禁之地——瀛台，终年38岁；二十二日下午两点左右，慈禧太后崩逝于仪鸾殿，终年74岁。对于光绪帝和慈禧的死因，历来众说纷纭。光绪帝陵墓崇陵曾经被盗，1980年，专家对崇陵进行抢救性挖掘工作，陵墓里面有价值的文物基本上被盗墓贼洗劫一空，但在光绪的尸骨上发现了几缕残留的头发。
这是可以研究光绪死因的证据。但在80年代的时候，科学技术相对落后，一直推迟到2003年，检测结果显示光绪皇帝的头发中砷的含量竟然是普通人的2404倍。显然是被毒死的，但是谁毒死了光绪帝，历来存在慈禧说和袁世凯说。
《崇陵传信录》记载：“时太后病泄泻数日矣，有谮上者谓帝闻太后病，有喜色。太后怒曰：我不能先尔死”的说法。《清稗类钞》也认为，慈禧太后担心自己死后，再度亲政的光绪皇帝可能清算自己，自己甚至会落得多尔衮的悲惨下场，于是就毒杀了光绪。
但是对于光绪的死因，爱新觉罗家族却一直以为是袁世凯干的。因为袁世凯曾经在戊戌变法时是“骑墙派”，既不明显支持保守派慈禧，也不明显支持光绪帝。所以光绪帝就误认为袁世凯是个可以信赖的人。
在慈禧和光绪矛盾公开化后，光绪就和康有为等商量个“围园杀后”的计谋，那时候慈禧退养颐和园，亲政的光绪住在紫禁城。不过慈禧太后的亲信荣禄一直是光绪帝惧怕的，所以光绪帝就把杀荣禄然后包围颐和园的重担交给了袁世凯。
袁世凯出卖了光绪帝。显然在袁世凯看来，光绪帝和康有为没有成功的可能，自己跟着也只能当炮灰。马上，光绪帝被慈禧太后囚禁在瀛台，这一囚禁就是十年，慈禧太后重新走到前台亲政。
所以光绪帝恨死了袁世凯。广为流传的一个故事是，光绪帝死前，已经得知了自己的侄子溥仪要继承大统了，自己的弟弟载沣是摄政王。在载沣看望光绪时，光绪给了他一个字条，上书“杀袁”。
其实说袁世凯是谋杀光绪凶手的人，大部分是爱新觉罗后裔。因为袁世凯后来当了“曹操”结束了清朝。所以爱新觉罗后裔恨袁世凯恨得牙根痒，这尤其以溥仪最甚，溥仪在懂事后恨袁世凯达到了空前程度。
也就是在溥仪的著作里，对袁世凯的说法，却矛盾了。溥仪在自传《我的前半生》中写道：“戊戌政变后，西太后对袁世凯一方面是十分重视的，几年工夫把他由直隶按察使提到直隶总督，外务部尚书，恩遇之隆，汉族大臣中过去只有曾、胡、左、李才数得上。另一方面，西太后对这个统率着北洋新军并且善于投机的汉族大臣，并不放心。当她听说袁世凯向贪财如命的庆王那里大量地送银子时，就警惕起来了。”
溥仪说：“但对于袁世凯，她没有再犹豫。光绪三十三年，内调袁为外务部尚书，参加军机。明是重用，实际是解除了他的兵权。袁世凯心里有数，不等招呼，即主动交出了北洋。”
这里明确说了慈禧临死前一年，已经开始警惕袁世凯了，所以剥夺了袁世凯的兵权。也就是说袁世凯即便想对光绪帝下手，也无能为力了。有人说袁世凯是勾结李莲英毒杀了光绪，二人也有合作弄权的经历。但是李莲英的鼻子是最灵敏的，曾经的合作，是袁世凯蒸蒸日上的时期，他一看袁世凯要失宠，绝对不会再冒险帮他。
那么在那时能杀光绪的也就慈禧了。清朝皇室后裔书法大家启功先生的曾祖父，甚至亲眼见过太监从病重的慈禧宫中传出一个盖碗，称“是老佛爷赏给万岁爷的塌喇”，而后，瀛台便传来了皇帝驾崩的噩耗。所以袁世凯是“背锅”侠，只因为当时爱新觉罗家族恨他入骨。
参考文献：《清稗类钞》、《崇陵传信录》、《清实录·德宗实录》、《我的前半生》