天天看点

CentOS 7下编译安装Open Babel2.4.1和python绑定

 一、Open Babel简介

Open Babel是一款开源自由软件,使用Open Babel可以将一种化学结构类型的文件格式转换成另一种文件格式,非常方便的进行各种类型的化学结构文件进行相互转换。

Open Babel由CC++编写,并提供C ++, Perl, Python等的API接口方便开发。

二、Open Babel 2.4.1的编译安装并绑定Python

第一步:下载openbabel 2.4.1安装包

下载地址:

https://github.com/openbabel/openbabel/releases

点击打开链接

第二步:安装boost库

yum install boost
yum install boost-devel 
yum install boost-doc      

第三步:安装gcc、g++、mke\cmkae

yum install gcc
yum install gcc-c++
yum install make
yum install cmake      

第四步:安装依赖的开发库

yum install zlib-devel
yum install libxml2-devel
yum install cairo-devel      

Eigen库安装,直接下载Eigen2和Eigen3版版本解压至usr/local/include

http://eigen.tuxfamily.org/index.php?title=Main_Page

第五步:支持Python(Python2.7)绑定,安装python开发库

yum install python-devel      

第六步:编译安装

tar zxvf openbabel-2.4.1.tar.gz
mkdir build
cd build
cmake ../openbabel-2.4.1 -DPYTHON_BINDINGS=ON      #编译安装Python绑定 
make
make test
make install      

第七步:配置环境变量

gedit ~/.bashrc
#open babel
export PATH=/usr/local/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/lib
export PYTHONPATH=/usr/local/lib/python2.7/site-packages:$PYTHONPATH   #Python路径添加      

source ~/.bashrc

最后一步:

检查Open Babel 2.4.1和Python绑定是否安装成功

检查Open Babel 2.4.1

CentOS 7下编译安装Open Babel2.4.1和python绑定

Python绑定是否成功

CentOS 7下编译安装Open Babel2.4.1和python绑定