一九三四年十一月，红25军长征后，留下的部队有中共皖西道委领导的第82师，第1、第2两路游击师（相当于营）和鄂东北道委领导的鄂东独立团，第3、第9两路游击师，以及红25军的两个连和一个手枪分队，共近两千人，在商城和金寨边界、商城南部、大悟山、老君山等几小块游击根据地坚持斗争。同年十二月，蒋介石调集十个师的兵力，在反动地方武装的配合下，对我发动"清剿"，游击根据地被敌占领。
一九三五年一月，原鄂豫皖省委委员兼皖西道委书记高敬亭，在太湖县的凉亭坳召开鄂豫皖边区干部会议，组成以高敬亭为书记的新的鄂豫皖省委，重新组建红28军，下辖第82师第244团和一个手枪团，高敬亭兼军政治委员（未设军长），并确定在英山、太湖、潜山、霍山一带，建立新的游击根据地。红28军主力，依托大别山开展游击战争，有力地打击了进攻之敌。同时，皖西特委率红28军一部组成的第246团，在霍山、舒城、潜山一带活动，开辟了新的根据地。鄂东北道委领导的部队，也积极活动，重新组建了一个独立团。
一九三五年底，蒋介石从贵州和其他地区调来的三个师，会同第11、第25路军，再次对我发动"清剿"。红28军以营为单位分散活动，在山区和平原广泛开展游击战争，并抽调少量部队加强地方便衣队，采取袭击、伏击等战术打击敌人，经过一年的斗争，歼灭和击溃敌人正规军不下十个营，游击区扩大到五十余县的范围，红28军和各游击队都得到很大发展。一九三七年四月，文以百集中十几个师和三十几个保安团，在卫立煌的指挥下，又一次对我发动"清剿"。红28军仍以分散活动对付敌之"清剿"。
我第244团第1营先后攻占大小集镇三十余个，并和手枪团一部挺进到豫南游击区，会同豫南游击队打击敌人。至十月，红军游击队集中时，还保存两千余人。
高敬亭居功至伟。
1939年高敬亭被冤杀。1975年11月30日，毛泽东接到高敬亭的女儿高风英请求澄清父亲被害原因、作出结论的信。毛泽东指示有关部门重新审查，在有关高敬亭的材料上批示：“我觉此案处理不当。”经中央军委组织有关部门核查，1977年4月27日，解放军总政治部发出《关于给高敬亭同志平反的通知》。《通知》肯定了高敬亭的功大于过的历史，认为“将其处死是错误的”。
1977年4月27日,中国人民解放军总政治部发出了《关于给高敬亭同志平反的通知》。1980年4月,高的家属与有关部门在合肥市烈士陵园为高举行了隆重的骨灰安放仪式。