（一）阿笠博士
新一变小后求助阿笠博士，得知新一身份后，帮他发明了许多装备，助他破案。
（二）工藤夫妇【新一父母 / 优作·有希子】
从国外回来后，通过阿笠博士得知新一变小的事情。
（三）宫野明美
临死前，柯南亲口承认了自己的真实身份。
（四）灰原哀【宫野志保】
“APTX4869”主要发明者，两次调查新一的家，发现新一小学的衣服不见了，最后得知变小的工藤新一就是柯南，之后也一直帮助柯南破案。
（五）服部平次
在一次事件中，柯南不小心用麻醉枪射中了服部，装睡听到了柯南的推理，最后逼柯南承认自己的真实身份。
（六）怪盗基德
假扮白鸟警官时，看见柯南在给阿笠博士打电话调查事件，推理出柯南就是工藤新一。
（七）贝尔摩德
在贝姐寄给柯南的信得知，封面写着工藤新一，开头写着工藤柯南，由此得知贝姐知道柯南的真实身份【主线剧场都没有具体说明，柯南推测的依据是贝姐是自己母亲的朋友她可能见过新一小时候的照片】。
（八）本堂瑛祐
瑛祐当着柯南的面说喜欢小兰，加上之前的调查他怀疑柯南就是新一，最后用“激将法”令柯南承认自己的真实身份。
（九）泽田弘树
通过“茧”的体验游戏装置，诺亚方舟读取了柯南脑中的信息，从而得知了柯南的真实身份。
（十）赤井秀一【冲矢昴】
一次事件中，被冲矢昴看到柯南用变声器变成新一的声音跟小兰说话，由此得知秀一也知道了柯南的真实身份。
（十一）世良真纯、赤井玛丽【世良、秀一、秀吉的母亲】
十年前她们在沙滩上见过小时候的新一，通过“我是福尔摩斯的弟子”这句话，由此推断出柯南跟自己的母亲一样都变小了，从而得知柯南真实身份。
（十二）鲁邦三世、峰不二子、次元大介、石川五右卫门
通过调查得知柯南身份。
（十三）阿郎史密斯
临死前，柯南向他承认了自己的真实身份。
（十四）伊东末彦
通过指纹知道柯南就是工藤新一，因为他双目失明也不能说是完全知道。
（十五）爱尔兰
通过对比指纹，知道柯南就是工藤新一，最后为救柯南而死。
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