美國La Jolla免疫研究所的一個研究小組與J. Craig Venter研究所的研究人員合作，使用SARS-CoV的資料來預測SARS-CoV-2的哪些部分能夠激活人類免疫系統。美國La Jolla免疫研究所的一個研究小組與J. Craig Venter研究所的研究人員合作，使用SARS-CoV的資料來預測SARS-CoV-2的哪些部分能夠激活人類免疫系統。
免疫學家使用了SARS-CoV冠狀病毒(目前與SARS-CoV-2的關系最為密切)中的資料來識别免疫系統的B細胞和T細胞可以反應的病毒區域。研究人員說，他們的發現為疫苗設計提供了關鍵資訊。
該研究的主要作者，美國拉荷亞免疫研究所（LJI）傳染病和疫苗研究中心教授Alessandro Sette博士說：“目前，關于病毒哪部分引起人類強烈反應的資訊還很有限。” “了解某些病毒區域的免疫原性，換句話說，了解免疫系統對病毒的哪個部分做出反應以及強度如何，與有希望的候選疫苗的設計及其評估具有直接的關系。”
這些表位還使得能夠形成存儲單元，如果再次遇到相同的結構，則驅動更快的響應。這些病毒表位及其相對免疫原性的圖譜可能會有益于嘗試設計或修飾疫苗以預防COVID-19的研究人員。
他們的研究中，研究小組使用了基于LJI的免疫表位資料庫(IEDB)的可用資料，該資料庫包含來自3600種不同物種的600,000多個已知表位，以及病毒病原體資源(ViPR)，這是有關病原病毒資訊的補充存儲庫。該小組從SARS-CoV彙編了已知的抗原決定簇，并将相應區域定位到SARS-CoV-2。
Sette實驗室的博士後研究員Alba Grifoni博士解釋說，能夠将10個B細胞表位定位到新的冠狀病毒，并且由于SARS-CoV和SARS-CoV-2之間總體上高度相似，是以SARS-CoV中具有免疫優勢的相同區域的可能性很高，它們在SARS-CoV-2中也占主導地位。
- 尖峰糖蛋白上有五個-病毒表面的冠狀投影；
- 膜蛋白中有兩個-膜蛋白包埋在包裹病毒外殼的膜中；
- 核蛋白中的三個-病毒的外殼是由核蛋白形成的。
在類似的分析中，T細胞表位也主要與棘突糖蛋白和核蛋白相關。
Grifoni博士還使用IEDB托管的表位預測算法來預測線性B細胞表位，該方法還指出了較早發現的兩個刺突蛋白表位。
為了證明基于與SARS-CoV同源性而鑒定出的SARS-CoV-2 T細胞表位，Grifoni博士将它們與IEDB精确确定的表位進行了比較。使用這種方法，能夠驗證基于與SARS-CoV的序列相似性鑒定出的17個SARS-CoV-2 T細胞表位中的12個。
Sette博士說：“發現許多B細胞和T細胞表位在SARS-CoV和SARS-CoV-2之間高度保守的事實為疫苗開發提供了一個很好的起點。” “專門針對這些區域的疫苗政策可能産生的免疫力不僅具有交叉保護作用，而且還對正在進行的病毒進化具有相對的抵抗力。”