由于水環境的惡化、飼養密度過大、飼料的投放量過高以及藥物抗生素的濫用，使水中營養鹽紊亂和缺乏，造成水環境破壞，有機質在水體大量的富集，而水中溶氧的下降引發的一系列問題，有毒有害物質的産生，氨氮、亞鹽、硫化氫等理化名額的超标，同時寄生于鰓絲的蟲害也在不斷的增加造成生理性缺氧。飼料投放量過高，投放不合理引起消化代謝性疾病和肝膽負擔過重引發的肝膽疾病。
草魚屬于草食性魚類，在投喂的飼料中以植物性飼料和粗纖維為主，同時飼料中添加多種維生素，以保證維生素的供給，配合蛋白和能量彌補飼料中的營養不足。選擇蛋白優質、配比合理的飼料，不僅可以提高飼料蛋白的轉化率，降低餌料系數，同時還可以減少飼料中氮元素在水中的轉化，防止氨氮對水體的破壞。
如果飼料中蛋白含量過高或投放量過大，非常容易引起草魚的脂肪肝和腸炎。在飼料投放的過程中，一定要注意保護肝膽的健康，定期在飼料中添加保肝護膽的藥物，以解除肝膽中毒素的蓄積，減輕肝膽的負擔，維持正常的生理功能。
想要保證草魚的高産就要合理放養，密度不可過大，降低池塘載魚量，不僅減少了疾病的發生率，還可以減少因飼料的投入量和糞便的産出量過多對水環境的污染。在飼料大量投喂期間，定期的使用有益菌種，比如：芽孢杆菌、光合細菌、硝化菌和反硝化菌、乳酸菌、EM菌等生物制品來改良水質，平衡水體藻相菌相，減少氨氮、亞鹽、硫化氫等有毒有害物質的産生和積累；同時加強改底，防止底質惡化産生有毒有害物質。
及時發現和殺滅水體中的寄生蟲，可以防止草魚因鰓部大量寄生而導緻生理性缺氧，以保證肝膽生理功能的正常。合理消毒，減少使用對水體傷害較大，殘留時間過長的藥物。