东汉时期，全国被划分为十三个州，各州下辖的郡与国数量不一，州作为监察区存在，亦称部。每州设立刺史或州牧一人，负责巡视所属郡国，监督郡县官员与地方势力，纠察不法行为，并有权弹劾贪官污吏。至东汉灵帝中平五年，朝廷重臣开始被委以州牧之职，此后，州逐渐转变为行政区，州牧则成为固定设置的地方军政长官。
【1. 司隶校尉部（司隶）】
辖七郡，共一百零六县，治所设于洛阳县（今河南洛阳东北）。其辖境大致涵盖今河北南部、河南北部、山西南部及陕西渭河平原。主要郡城包括河南、河内、河东、弘农。
【2. 豫州】
辖六国，九十七县，治所在谯县（今安徽亳州）。其辖境相当于淮河以北、伏牛山以东的河南东部及安徽北部。主要郡城有颍川、汝南、梁国、沛国、陈国。
【3. 冀州】
辖九国，一百县，治所初设邺县（今河北临漳西南），后曹魏移至信都县（今河北冀县）。辖地涵盖今河北中部和南部、山东西部、河南北部。主要郡城包括魏郡、钜鹿、常山、中山、安平、河间、清河、赵国、勃海。
【4. 兖州】
辖八国，八十县，治所在昌邑县（今山东金乡西北）。其辖境相当于今山东西南及河南东部。主要郡城有陈留、东郡、东平、任城、泰山、济北、山阳、济阴。
【5. 徐州】
辖五国，六十二县，治所初设郯县（今山东郯城县），后汉末移至下邳（今江苏邳县东），曹魏再移至彭城（今江苏徐州）。其辖境相当于今江苏长江以北及山东南部地区。主要郡城有东海、琅邪、彭城、广陵、下邳。
【6. 青州】
辖十一国，六十五县，治所在临淄县（今山东淄博市临淄北）。其辖境覆盖今山东临淄以东的北部地区。主要郡城有济南、平原、乐安、北海、东莱、齐国。
【7. 荆州】
辖七国，一百一十七县，治所初设汉寿县（今湖南汉寿县北），后汉末移至襄阳县（今湖北襄樊市）。其辖境广泛，包括今湖北、湖南大部，以及河南、贵州、广东、广西等省的一小部分。主要郡城有南阳、南郡、江夏、零陵、桂阳、武陵、长沙。
【8. 扬州】
辖六国，九十二县，治所初设历阳（今安徽和县），后汉末移至寿春（今安徽寿县）。其辖境跨越今安徽淮河以南、江苏长江以南及江西、浙江、福建三省，还包括湖北东部、河南东南部。主要郡城有九江、丹阳、庐江、会稽、吴郡、豫章。
【9. 益州】
辖十二国，一百一十八县，治所初设雒县（今四川广汉），后汉末移至成都（今四川成都）。其辖境辽阔，包括今四川、云南、贵州大部，以及陕西、甘肃、湖北的一小部分。主要郡城有汉中、巴郡、广汉、蜀郡、犍为、牂牁、越巂、益州、永昌、广汉属国、蜀郡属国、犍为属国。
【10. 凉州】
辖十二国，九十八县，治所初设陇县（今甘肃张家川回族自治县），后曹魏移至姑臧县（今甘肃武威县）。其辖境涵盖今甘肃、宁夏回族自治区、青海湟水流域及陕西西部。主要郡城有陇西、汉阳、武都、金城、安定、北地、武威、张掖、酒泉、敦煌、张掖属国、居延属国。
【11. 并州】
辖九国，九十八县，治所在晋阳（今山西太原西南）。其辖境跨越今山西、内蒙古自治区、河北、陕西的部分地区。主要郡城有上党、太原、上郡、西河、五原、云中、定襄、雁门、朔方。
【12. 幽州】
辖十一国，九十县，治所在蓟县（今北京大兴县西南）。其辖境包括今北京市、河北北部、辽宁南部及朝鲜西北部。主要郡城有涿郡、广阳、代郡、上谷、渔阳、右北平、辽西、辽东、玄菟、乐浪、辽东属国。
【13. 交州】
辖七国，治所初设龙编（今越南河内以北），后三国孙吴移至番禺（今广东广州）。其辖境覆盖今广东、广西壮族自治区的大部分，以及越南的一部分地区。主要郡城有南海、苍梧、郁林、合浦、交趾、九真、日南。