9.11事件发生后几天，美国联邦调查局（FBI）在波士顿的一家旅馆里找到了驾机撞向世贸大夏的穆罕默德·阿塔的行李。行李中装有航空公司制服和一盘录有驾机自杀者留言的录像带。FBI也很快确定了19名劫机者的身份，阿塔是埃及人，另一些来自沙特和阿曼。
世贸大厦被撞
德国情报当局在恐怖袭击事件后监听到的一个电话通话内容提供了本·拉丹同这起事件的联系。这是在本·拉丹的信奉者之间进行的一次通话，其中提到了“为作战而出发的30人”。美国联邦调查局已经公布了19名劫机嫌疑犯的名字和照片，并且认为，其余11人是在放弃行动计划之后逃走了。
19名嫌犯照片（百度照片）
在19名劫机嫌疑犯当中，至少有4人在本·拉丹设在阿富汗境内的营地接受过驾驶训练，他们在几年前就有组织地策划过恐怖活动事件。FBI据信还找到了与本·拉丹有联系的一个银行账户向参与恐怖袭击的嫌疑犯转入资金的证据，德国警方说劫机者在德国汉堡从事整个事件的策划，英国警方声称找到了在英国训练恐怖袭击事件参与者的飞行教官。这样在纽约发生的事件就被与本·拉丹及其在阿富汗的恐怖组织联系起来。
1、 全球搜捕嫌犯
9．11事件后，联合国安理会通过了一项决议，要求所有成员国追捕恐怖分子及其支持者，以及为恐怖分子提供经济支持的集团。全球掀起了一场搜捕行动。
北约驻波黑维和部队的士兵在萨拉热窝逮捕了4名嫌疑人，查获了装有大量现金的保险柜。
英国当局9月29日逮捕了27岁的卡迈勒·达乌迪，以及一名阿尔及利亚飞行员，名为卢特菲·拉伊西。检察官认为，他被怀疑与美国发生的恐怖性袭击有直接联系的外国人，现年27岁的拉伊西是一名飞行教员，他曾经给一些9.11事件劫机者讲过课，正是这些劫机者开着飞机冲向了五角大楼，但他本人坚决否认与这次袭击事件有任何牵连。
法国向美国提供了潜伏在美国的恐怖分子扎哈里亚斯·穆萨维的情报。联邦调查局认定，9.11事件的嫌犯涉在汉堡待过。 穆罕默德·阿塔（33岁）、马尔万·谢希（23岁）以及齐亚德·萨米尔·贾拉这3个人可能就是撞向世贸大厦和五角大楼德3架飞机的劫持者，这三人在案发前一直潜伏在美国，等待行动命令。西班牙警方发现2011年夏天穆罕默德·阿塔曾经出现在巴塞罗那以南120公里处的地方。
二、认定9.11事件的策划者是本拉登的亲家
英国公布了调查结果，认为穆罕默德·阿提夫负责策划了整个袭击过程。阿提夫又名阿布·哈夫斯·马斯里，据情报人士透露，他原来是埃及的警察，20世纪80年代的时候四处招募阿拉伯人到阿富汗同苏联作战，还帮助本·拉丹建立了“基地”组织。他是本·拉丹最为信任的、级别最高的助手，同时也是“基地”组织的军事首脑，1998年他曾经协助策划了美国驻肯尼亚和坦桑尼亚大使馆爆炸事件。阿提夫与拉登的关系极为密切，今年1月，他的女儿还嫁与了本·拉丹的长子。美国把本拉丹列为头号嫌疑犯，全球范围内迅速展开了搜捕活动。
哈立德
穆罕默德·谢赫·哈立德也被认为是911事件的策划者之一。他曾在美国留学。获得工程学学位。
三、本拉登9.11事件前夕告诉亲人将有重大新闻
本拉登通缉令
“911”事件前夕，本·拉丹加紧了宣传攻势，积极地为袭击犹太人和美国的目标制造舆论。美国新闻界未经证实的报道称，本·拉丹在9月10日的时候曾经打电话给养母哈利法，告诉她将有“重大新闻”，从此之后杳无音信。8月至9月初的时候，本·拉丹在世界各地的亲信还接到通知：要求9月10日前赶回阿富汗。一个有趣的情况是：在2021年，塔利班宣称9.11事件不是本拉登组织的。
世贸大厦区域
四、美国启动“最长战争”
美国认定本·拉丹为恐怖事件的真正制造者，决心严厉打击保护他的塔利班，并将其抓获归案。北京时间2001年10月8日凌晨零时27分，英美正式对阿富汗发起了第一轮攻击，美国动用了15架B－1，B－2和B－52轰炸机，包括F－117A在内的25架战斗机，发射了50枚巡航导弹，阿富汗的三大城市喀布尔、坎大哈与贾拉拉巴德均遭袭击，长达20年的战争打响了。