最近研究了一下DICOM和BMP檔案轉換的問題,也是很頭大。度娘了很久,也在CSDN等論壇看到一些斷斷續續的檔案,最主要的是代碼隻是片斷,不是完整的實作。頭大了。
首先,了解一下BMP檔案格式,BMP檔案的顯示是從左下開始顯示,而DICOM顯示圖像是從左上開始。是以如果你直接解析BMP檔案的話,記得資料區工反轉一下,否則生成DICOM時看到的圖像是倒着的。隻需要反轉BMP圖像的行,列不需要反轉。
不過好在Microsoft的C#給我們提供了一個較好的類庫叫Bitmap類,使用它可以不用管這個反轉了。
首先要從BMP圖中擷取圖像資料區,代碼如下:
public static byte[] GetPixels(Bitmap bitmap)
{
byte[] bytes = new byte[bitmap.Width * bitmap.Height*3];
int wide = bitmap.Width;
int i = 0;
int height = bitmap.Height;
for (int y = 0; y < height; y++)
{
for (int x = 0; x < wide; x++)
{
var srcColor = bitmap.GetPixel(x, y);
//bytes[i] = (byte)(srcColor.R * .299 + srcColor.G * .587 + srcColor.B * .114);
bytes[i] = srcColor.R;
i++;
bytes[i] = srcColor.G;
i++;
bytes[i] = srcColor.B;
i++;
}
}
return bytes;
}
申請的資料為什麼是圖像的寬高乘積的3倍,這是因為R,G,B各占一個Byte。如果采用上面代碼中注釋的行,生成的DICOM檔案圖像就是灰階圖像(黑白圖了)。
然後是真正的轉存DICOM檔案了。代碼如下:
public static void ImportImage(string file)
{
Bitmap bitmap = new Bitmap(file);
//bitmap = GetValidImage(bitmap);
byte[] pixels = GetPixels(bitmap);
MemoryByteBuffer buffer = new MemoryByteBuffer(pixels);
DicomDataset dataset = new DicomDataset();
//FillDataset(dataset);
dataset.Add(DicomTag.PhotometricInterpretation, PhotometricInterpretation.Rgb.Value);
dataset.Add(DicomTag.Rows, (ushort)bitmap.Height);
dataset.Add(DicomTag.Columns, (ushort)bitmap.Width);
dataset.Add(DicomTag.BitsAllocated, (ushort)8);
dataset.Add(DicomTag.SOPClassUID, "1.2.840.10008.5.1.4.1.1.2");
dataset.Add(DicomTag.SOPInstanceUID, "1.2.840.10008.5.1.4.1.1.2.20181120090837121314");
DicomPixelData pixelData = DicomPixelData.Create(dataset, true);
pixelData.BitsStored = 8;
//pixelData.BitsAllocated = 8;
pixelData.SamplesPerPixel = 3;
pixelData.HighBit = 7;
pixelData.PixelRepresentation = 0;
pixelData.PlanarConfiguration = 0;
pixelData.AddFrame(buffer);
DicomFile dicomfile = new DicomFile(dataset);
dicomfile.Save(@"e:\dicomfile.dcm");
SaveDicomFile2(pixels, bitmap.Height, bitmap.Width);
}
其中傳入參數就是BMP/JPG/PNG圖像的路徑。這樣你隻需要一個入口程式(比如控制台的Main函數)就可以将一個圖檔轉為DICOM還是彩色的。
這裡隻設定了DICOM必須的幾個字段,這幾個字段的意義可以參考官方标準說明。部分說明如下:
DICOM檔案格式:
1)Samples Per Pixel:
标簽為(0028,0002),具體的介紹在DICOM3.0标準第3部分的附錄C7.6.3.1。含義表示【the number of separate planes in this image】,就像PhotoShop中的通道,每個通道表示一種顔色(除了RGB三個通道以外,也會存在第四個通透性通道)。對于灰階圖像(monochrome或gray)和顔色表圖像(palette,就是BMP格式中介紹的有調色闆的BMP檔案),該标簽值為1,RGB圖像或其他色彩模式圖像,該标簽值為3。本執行個體中使用的BMP圖像是RGB格式的,是以SamplePerPixel=3,起初的檔案格式錯誤就是由于該字段設定為1所緻。
2)Photometric Interpretation:
标簽為(0028,0004),具體介紹在DICOM3.0标準第3部分的附錄C7.6.3.1.2。該字段常見的值有MONOCHROME1、MONOCHROME2、PALETTE COLOR、RGB,其中MONOCHROME1和MONOCHROME2表示單通道灰階圖像,隻是兩者對黑色和白色的映射相反而已;PALETTE COLOR就是BMP中提到的調色闆圖像,此時需要SamplesPerPixel字段為1,;RGB是常見的R(紅)、G(綠)、B(藍)三通道彩色圖像,此時SamplesPerPixel字段值為3,這就是我們執行個體中使用的圖像。除此以外DICOM3.0标準中還給出了YBR_FULL、HSV、ARGB、CMYK等方式,此處就不詳細介紹了。
3)Planar Configuration:
标簽為(0028,0006),具體介紹在DICOM3.0标準第3部分附錄C7.6.3.1.3。當Samples Per Pixel字段的值大于1時,Planar Configuration字段規定了實際像素資訊的存儲方式,具體如下:
![](https://img.laitimes.com/img/9ZDMuAjOiMmIsIjOiQnIsIyZuBnLzImZmVmM5U2NyADZwEWMjJzY1MTNlhTYxQGNhlDNyITZlRTZhN2Yx8CXt92Yu4GZjlGbh5SZslmZxl3Lc9CX6MHc0RHaiojIsJye.png)
BitsAllocated 每一種顔色值所配置設定的存儲位數,一般彩色是8,灰階可以設定到16,不能大于16。
BitsStored 像素值的實際存儲位數
HighBit 像素值存儲的最高位(一般是BitsStored-1)。
關于BMP檔案格式說明可參照:
https://blog.csdn.net/zjq_1314520/article/details/53830349