RDKit：化合物相似性搜尋

化合物相似性

化合物相似性在化學資訊學和藥物發現中具有悠久的曆史，許多計算方法采用相似度測定來鑒定研究的新化合物。

分子相似性是許多虛拟篩選技術的理論基礎。分子相似性分析方法可以從整體上劃分為全局方法和局部方法。局部相似性專注于分子拓撲結構上是否具有特定的官能團以及是否具有某些特定的對于分子識别至關重要的原子排布。全局分子相似性總是與小分子的生物響應行為聯系在一起，不斷與生物活性緊密相關的分子特征做任何假設；但是，與生物活性無關特征被納入考慮範圍，無疑會對分子相似性評價産生負面影響。

基于分子相似性的虛拟篩選核心是“相似性假設”，這個假設首先由 Johnson 和 Maggiora提出，即結構類似的化合物具有類似的物化性質和生物活性，相似性方法在醫藥領域極具價值。

本執行個體通過計算分子的Morgan指紋進行相似性比對。