為嵌入式應用選擇微控制器有幾個原因，即低成本，高內建度，增加可靠性，節省空間等。
準備所需硬體接口清單
使用微控制器的基本硬體框圖，準備一份微控制器需要支援的所有外設接口的清單。微控制器中有兩種常見的接口類型需要列出。第一種是通信接口，這些是外圍裝置，如USB，SPI，I2C，UART等。這些都極大地擾亂了微控制器需要支援多少程式空間。第二種接口是“數字輸入和輸出”，（A到D）模拟到數字輸入，脈沖寬度調制等。這兩種類型的接口将控制微控制器必不可少的引腳數。
選擇架構
架構的選擇可以極大地影響嵌入式應用的微控制器。根據以上資訊，工程師應該能夠開始了解所需的微控制器架構。不要忘記記住可能的未來需求和功能蠕變。僅僅因為你現在可以使用8位微控制器并不意味着你不應該為即将推出的功能研究16位微控制器，甚至不能輕松使用。不要忘記選擇微控制器選擇可以是疊代過程。您可以在此步驟中選擇16位部分，但稍後在步驟中發現32位ARM部分運作良好。這個階段隻是讓工程師開始尋找正确的方向。
認識到記憶體要求
微控制器的兩個非常關鍵的存儲器元件是RAM和閃存。確定變量空間不足，程式絕對是最重要的。選擇具有太多這些功能的部分遠遠不夠簡單。畢竟，你可以不斷地從更多開始，然後轉移到同一晶片系列中更受控制的部分。使用應用程式中包含的軟體架構和通信外圍裝置，設計人員可以猜測應用程式需要多少記憶體。
觀察成本和功率限制
如果微控制器将由電池和移動電源供電，那麼確定這些部分是低功耗的是絕對危險的。如果它不符合電力需求，那麼請繼續準備清單，直到您選擇少量。不要忘記觀察處理器的零件價格。雖然價格在幾個部分的數量上逐漸接近1美元，但如果它高度集中，那麼價格可能是危險的。
選擇開發套件
選擇微控制器的最佳部分之一是，發現要使用的開發套件并觀察微控制器的内部工作。如果套件不存在那麼特定部件很可能不是一個好的選擇，他們應該回過頭幾步，發現更好的部分。目前大多數套件的價格低于100美元。支付更多費用太多了。另一部分可能是更好的選擇。
最後，我們可以得出結論，在為嵌入式應用選擇微控制器時需要考慮許多功能。包括硬體，資料傳輸，PWM端口，封裝，功耗，存儲器大小，成本等。