首先是他們的葉片，輪葉黑藻為5片，而伊樂藻為3片，第二，輪葉黑藻的葉片上會有一些小的鋸齒，而伊樂藻沒有這個特點，最後輪葉黑藻耐高溫不宜腐壞水質，而伊樂藻不耐高溫，對水質會造成一定的影響。
輪葉黑藻和伊樂藻的差別
輪葉黑藻是多年生的沉水植物，根莖比較細長，大概為50~80厘米，而伊樂藻雖然也是一種優質而又高産的沉水植物，但他們還是有一定量的差別的，首先是他們的葉片，輪葉黑藻為5片，而伊樂藻為3片。
第二種則是，輪葉黑藻的葉片上會有一些小的鋸齒，而伊樂藻沒有這個特點，因為兩種沉水植物的形狀和大小樣式甚至于他們的生長高度和寬度都大緻一樣，是以不注意觀察的話會很難發現這個小的細節問題。
最後一種的則是利用兩種植物的耐溫和水質環境污染進行區分的，在這方面輪葉黑藻屬于耐高溫，不會造成水質污染的，而伊樂藻則是不耐高溫，同時也會對水質也會造成一定的污染的。
伊樂藻
目前來說，要區分輪葉黑藻和伊樂藻差別，多是使用這三種方式，除非是用作别的用途，不然這兩種植物的作用和效果差別都不是很大，它們都可以用作于小龍蝦養植所食用的餌料和水草種植品種。