黃菖蒲是鸢尾科鸢尾屬植物，菖蒲是天南星科菖蒲屬植物，二者雖然名字相近，但是并無關聯，黃菖蒲的花色為大黃色，菖蒲的花為黃綠色肉穗花序，黃菖蒲的葉子是暗綠色的，比較寬，菖蒲的葉子是淺綠色，比較細長。
1、科屬不同
黃菖蒲
黃菖蒲和菖蒲名字雖然差不多，但是它們沒有任何關聯，黃菖蒲是鸢尾科鸢尾屬植物，菖蒲是天南星科菖蒲屬植物，很多人都不知道黃菖蒲和菖蒲的差別有哪些，誤以為它們是同一種植物。
2、花色不同
黃菖蒲的花為大黃色，花色鮮豔明亮，上面有少許黑色條紋，花長7cm左右，寬5cm左右花瓣有兩層，内部花隻有外花1/3大小，菖蒲的花是黃綠色的肉穗花序，花直生于莖幹上，沒有花柄。
3、葉子不同
菖蒲
黃菖蒲的葉子是暗綠色的，闊劍狀的葉片，長度在60cm左右，管約為3cm，而菖蒲的葉子是淺綠色的，細劍狀葉片，比起黃菖蒲的葉片要窄一些，隻有1～2cm寬，但是要比黃菖蒲葉子長不少，能有1m長以上。
4、株高不同
菖蒲的葉子細長，莖幹短小，長到到一定高度的時候就會倒伏，一般都不會太高，黃菖蒲的莖幹較長，尤其是花柄下的莖幹，相比起來要比菖蒲高一些，能有100～140cm高，菖蒲葉子較短時能有1m以上，等到葉子過長而倒伏的時候隻有60～80cm高。