染井吉野櫻和日本晚櫻的差別在于樹形、樹皮顔色等。染井吉野櫻樹型較為高大可達17米，日本晚櫻較為嬌小最高可達8米。染吉野櫻樹皮呈灰色。晚櫻樹皮呈銀灰色，染井吉野櫻枝條呈褐色，晚櫻新芽枝條成深褐色。染井吉野櫻花顔色偏白，晚櫻花顔色偏紅。
日本晚櫻和染井吉野櫻的差別
染井吉野櫻的樹形較為高大，最高可達17m。日本晚櫻的樹形較為嬌小，高可達8米。染井吉野櫻樹皮呈銀灰色，枝條順序不雜亂。日本晚櫻有唇形皮孔，枝條較為淩亂。
染井吉野櫻葉片長3-8厘米，寬2-4厘米，日本晚櫻晚櫻的葉片長5-12厘米，晚櫻的葉子比早櫻的葉子要大。染井吉野櫻葉片呈倒卵形，而日本晚櫻呈橢圓狀倒卵形。
染井吉野櫻小枝為褐色，樹幹的皮孔較為稀少，新枝上沾有浮毛。晚櫻的樹皮略帶銀灰色，樹幹上的皮孔小而多。新芽顔色較深，呈深褐色，芽較大。
染井吉野櫻花瓣為5片，葉片呈卵圓形，多為單瓣花，顔色呈白色，開花時花較為稀少。日本晚櫻開花前呈淺粉色，花開時顔色更為鮮豔明亮，花瓣多為重瓣。花開時葉較少，花量較大。