蔡元培對中國中國教育、中國革命作出了重要貢獻，從他開始形成了較完整的教育體系和制度，力主教育改革，讓北大成為新文化運動的發祥地，甚至還幫助過許多著名學者，讓他們任教北大，發揮所長。
魯迅為什麼罵蔡元培
蔡元培對魯迅的賞識和幫助是“沒世不渝”的，郭沫若曾說過：“一直到魯迅的病殁，蔡元培是盡了沒世不渝的友誼。”
魯迅與景次長的關系沒有處好，差一點沒有被除名。多虧蔡元培看到裁員名單後及時制止，帶魯迅北上來到北京。不過，這回到了１９２７年，十幾年過後，已是時過境遷，魯迅與蔡元培這位前輩同鄉，在思想上已是“兩股道上跑的車”。
魯迅先是緻信江紹原：“季弗（許壽裳字季弗）有信來，先以奉聞。我想此事與兄相宜，因為與人鬥争之事較少，但不知薪水可真拿得到否耳。”“特約撰述員”這事“與兄相宜”，其實意思是說與“我”也相宜，而且這事就像天上掉餡餅，好得讓人不敢相信：“不知薪水可真拿得到否”。自己寫文章批評過蔡元培，蔡元培還會把這美差給自己嗎？魯迅有點惴惴不安。
又十天之後，确實的消息還沒有盼來，魯迅焦急難耐，幾乎有點失望，緻信江紹原說：“季弗所談事迄今無後文，但即有後文，我亦不想去吃，我對于該方面的感覺，隻覺得氣悶之至不可耐。”這段話恐怕是言不由衷，故作清高之态，“不想去吃”是假的，嫌聘書來得慢是真的。
又七天之後，緻信章廷謙雲：“季弗本雲南京将聘紹原，而迄今無續來消息，豈蔡公此說是以敷衍季弗者欤，但其實即來聘，亦無聊。”現在開始對蔡元培的人格表示懷疑了，而且一肚子怨氣，指斥蔡公“無聊”。
此事又拖了一個月，焦躁不安的魯迅實在按捺不住心中的怨氣，在緻章廷謙的又一封信中，盡情地發洩了對蔡元培的不滿：“太史之類，不過傀儡，其實是不在話下的，他們的話聽了與否，不成問題，我以為該太史在中國無可為。”蔡元培在清末曾做過翰林，是以稱“太史”，這裡對于蔡元培已經罵出口來了。
到了１２月，再也等不下去的魯迅開始直接寫蔡公寫信了，不過不能直說，得委婉一點。于是他借為昔日的學生荊有麟寫推薦信的機會，向蔡公巧妙地表達了自己葵藿向陽之意。本來魯迅對這個學生并不太明白底細，推薦信可寫可不寫，他寫這封信與其說是推薦荊有麟，不如說是試探着推薦自己。信中說他這位學生“忠于國事，服務已久”，其實是自喻；至于“辄不揣微末，特為介紹，進谒台端，倘蒙假以顔色，俾畢其詞，更賜指揮，實為萬幸”，哈哈，如此謙虛，哪得見前面給朋友的信中的清高和怨氣！為了飯碗，他不敢罵蔡太史是言而無信的“傀儡”和小人了。
終于，１２月８日，聘書來哉！魯迅心安理得地端起這個“無聊”的飯碗，一吃四年多。直到魯迅出席“左聯”，“黨國”忍無可忍，以其在此崗位上“絕無成績”被大學院裁撤。有人統計，大學院的薪水“定期支付四十九個月之久，未曾拖欠，共計一萬四千七百元大洋，折合黃金四百九十兩。”
“特約撰述員”被裁撤時，蔡元培曾設法阻攔，但沒有成功。
蔡元培幫胡适僞造學曆
１９１７年７月，胡适從美國學成回國，其時胡适并未獲得哥倫比亞大學博士學位，但蔡元培為了讓胡适進入北大不惜幫其僞造學曆。
蔡元培雖然有着十分十分深厚的舊學背景，但是他在教學上卻并不保守，還對胡适大為欣賞，并給予了他各大的幫助，稱蔡元培是胡适的伯樂，也并不為過。
胡适回國後，進入了北大任教，并領取了當時最高的年薪，這離不開蔡元培對胡适的支援。蔡元培甚至還親自為胡适所編纂的書籍做序。是以說胡适的功成名就，除了是因為胡适自身的出色外，還多虧了蔡元培的扶持。