木本植物有着明顯的主幹，分為喬木、灌木和灌木植物，草本植物沒有沒有明顯的主幹；莖部結構，木本植物内部含有較多的木質化細胞，莖部粗壯，草本植物莖部柔軟；生長習性，随着地理緯度的改變，草本植物中1年生以及2年生的植物生長習性會發生改變。
1、株型差別
木本植物和草本植物在株型上存在着一定的差别，其中木本植物上有着明顯的主幹，生長直立高大，分為喬木、灌木和半灌木植物。草本植物沒有明顯的主幹，株型生長矮小，高度不超過1米。
2、莖部結構
木本植物和草本植物的莖幹也有所差別，木本植物中含有較多的木質化細胞，木質化組織較多，莖部堅硬粗壯，可作為木材進行使用。而草本植物内不含有木質化細胞，莖部柔軟多汁。
3、生長習性
木本植物和草本的生長習性存在着一定差異，随着地理緯度的改變，草本植物中一年生、二年上以及多年生植物生長習性均會發生改變，小麥和大麥在春播和秋播時，為二年生草本，春播時，可生長為1年生草本。
4、生長周期
木本植物和草本植物的生長周期有所差別，其中木本植物大多為多年生植物，分為常綠和落葉植物，草本植物主要分為一年生、二年生和多年生植物。在冬季大多地面部位會出現枯萎死亡的狀況。