叢集Linux環境下安裝FSL
1.下載下傳安裝包
從FSL官網中[link]https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/FslInstallation/Linux下載下傳合适的Linux版本的fsl安裝包,名稱為fslinstaller.py
2.安裝
在該檔案所在路徑下打開指令視窗,使用指令:
su root
進入root權限(需要輸入叢集root權限的密碼,可詢問管理人員)
保證在python2版本環境下,指令視窗内輸入 :
python installer.py
等待下載下傳安裝至100%(此處不用管,等安裝完成即可)
3.環境配置
此時在終端輸入fsl指令會出現:
fsl:command not found
在終端輸入指令:
gedit ~/.bash_profile
在出現的視窗末尾輸入下列字段:
FSLDIR=/usr/local/fsl
. ${FSLDIR}/etc/fslconf/fsl.sh
PATH=${FSLDIR}/bin:${PATH}
export FSLDIR PATH
此時環境配置已完成。若輸入fsl後人出現指令不可用的提示,請重新開機該終端後輸入:
source ~/.bash_profile
此時輸入fsl即可彈出如下視窗: