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FSL的安裝叢集Linux環境下安裝FSL

叢集Linux環境下安裝FSL

1.下載下傳安裝包

從FSL官網中[link]https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/FslInstallation/Linux下載下傳合适的Linux版本的fsl安裝包,名稱為fslinstaller.py

FSL的安裝叢集Linux環境下安裝FSL

2.安裝

在該檔案所在路徑下打開指令視窗,使用指令:

su root
           

進入root權限(需要輸入叢集root權限的密碼,可詢問管理人員)

保證在python2版本環境下,指令視窗内輸入 :

python installer.py
           

等待下載下傳安裝至100%(此處不用管,等安裝完成即可)

3.環境配置

此時在終端輸入fsl指令會出現:

fsl:command not found
           

在終端輸入指令:

gedit ~/.bash_profile
           

在出現的視窗末尾輸入下列字段:

FSLDIR=/usr/local/fsl
. ${FSLDIR}/etc/fslconf/fsl.sh
PATH=${FSLDIR}/bin:${PATH}
export FSLDIR PATH
           

此時環境配置已完成。若輸入fsl後人出現指令不可用的提示,請重新開機該終端後輸入:

source ~/.bash_profile
           

此時輸入fsl即可彈出如下視窗:

FSL的安裝叢集Linux環境下安裝FSL