01. Violin Chart小提琴圖

1.1 定義

小提琴圖可以可視化一個或多個組的數值變量的分布。非常适合大型資料集，可用于替換箱線圖。

每個“小提琴”代表一個組或一個變量。該形狀表示變量的密度估計值：特定範圍内的資料點越多，該範圍内的小提琴就越寬。它非常接近箱線圖，但可以更深入地了解分布。

https://www.data-to-viz.com/graph/violin.html

1.2 實作

1.2.1 ggplot2

ggplot2-geom_violin()

library(ggplot2)
# create a dataset
data <- data.frame(
  name=c( rep("A",500), rep("B",500), rep("B",500), rep("C",20), rep('D', 100)  ),
  value=c( rnorm(500, 10, 5), rnorm(500, 13, 1), rnorm(500, 18, 1), rnorm(20, 25, 4), rnorm(100, 12, 1) )
)

# Most basic violin chart
p <- ggplot(data, aes(x=name, y=value, fill=name)) + # fill=name allow to automatically dedicate a color for each group
  geom_violin()
#p 
           

關于輸入格式的說明

long format：一行代表一次觀測，對一個對象不同時刻的觀測分布在不同的行之中

X axis: it needs to be have the class factor

Y axis: it needs to have the class numeric

# Basic violin
ggplot(data, aes(x=name, y=value, fill=name)) + 
  geom_violin()
           

wide format：一行不代表一次觀測，對一個對象不同時刻的觀測集中在同一行之中

需要用tidyr 庫的 gather（） 函數轉換

data_wide <- iris[ , 1:4]
#R内置資料集Iris資料集是常用的分類實驗資料集，由Fisher, 1936收集整理。Iris也稱鸢尾花卉資料集，是一類多重變量分析的資料集。資料集包含150個資料樣本，分為3類，每類50個資料，每個資料包含4個屬性。可通過花萼長度，花萼寬度，花瓣長度，花瓣寬度4個屬性預測鸢尾花卉屬于（Setosa，Versicolour，Virginica）三個種類中的哪一類。
#其它比較流行的資料集還有Adult,Wine,Car Evaluation等。
Sepal.Length	Sepal.Width	Petal.Length	Petal.Width
5.1	3.5	1.4	0.2
4.9	3.0	1.4	0.2
4.7	3.2	1.3	0.2
4.6	3.1	1.5	0.2
library(tidyr)
library(ggplot2)
library(dplyr)
data_wide %>% 
  gather(key="MesureType", value="Val") %>%
  ggplot( aes(x=MesureType, y=Val, fill=MesureType)) +
    geom_violin()
#%>% （向右操作符，forward-pipe operator）是最常用的一種操作符，就是把左側準備的資料或表達式，傳遞給右側的函數調用或表達式進行運作，可以連續操作就像一個鍊條一樣。現實原理如下圖所示，使用%>%把左側的程式的資料集A傳遞右側程式的B函數，B函數的結果資料集再向右側傳遞給C函數，最後完成資料計算。
#gather在這的功能是行列轉置，即将行名轉置為第一列"MesureType"，其他測量數值轉化為第二列"Val"
#簡單看一下資料情況
dd1 <- data_wide %>% 
  gather(key="MesureType", value="Val")
head(dd1)
    MesureType Val
1 Sepal.Length 5.1
2 Sepal.Length 4.9
3 Sepal.Length 4.7
4 Sepal.Length 4.6
5 Sepal.Length 5.0
6 Sepal.Length 5.4
#ggplot2的簡單用法
#aes 指定參與作圖的每個變量分别映射到哪些圖形特性， 比如映射為x坐标、y坐标、顔色、形狀等。 這些映射稱為aesthetic mappings或aesthetics，fill一般是填顔色，這個時候就參數應該是分組。
           

後續會不定時更新，關注不迷路~