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當一個已經感染了HIV的人暴露在相同或不同的HIV毒株下，就會發生二次感染或多次感染，稱之為超感染（Superinfection）。
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HIV超感染傳播模式示意圖
一、超感染的發生原因
HIV是一種變異性很強的病毒，分為HIV-1型和HIV-2型。HIV-1型可進一步分為M、N、O、P組。M組毒株是導緻全球艾滋病流行的主要病毒株，至少包括A-K 11種亞型以及各種流行重組型（CRF）。HIV-2型至少有A-G 7種亞型。
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主要HIV亞型的全球分布
大陸以HIV-1為主要流行株，已發現的有A、B(歐美B)、B’(泰國B)、C、D、F、G、H、J和K 10個亞型，還有不同的流行重組型和獨特重組型。由于HIV亞型衆多，當HIV感染者再次感染一種新的系統發育上不同的HIV毒株時，兩種不同的HIV毒株可以進入同一細胞，通過交換基因片段，形成新的重組病毒，這種情況下就會發生HIV超感染。在注射吸毒人群中，感染人群中超感染的發生率可達13%。
二、超感染的不良後果
雖然科學家們普遍認為，HIV超感染與病毒載量更快增加有關，并對CD4細胞減少有一定影響，但它不會導緻更快的疾病進展。
但如果超感染患者第二次感染的是耐藥毒株，超感染可能會改變患者的抗病毒治療效果和艾滋病的臨床程序。最近有報道稱，一名經抗病毒治療長期穩定十幾年的感染者，突然發生病毒載量反彈。經流行病學史追溯和實驗室檢測發現，感染者因與HIV陽性伴侶的反複無保護性行為導緻發生超感染，新感染毒株是與原發感染不同亞型的耐藥毒株，原治療方案和機體已建立的免疫系統無法抵禦新毒株，不得不更換治療方案。
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三、超感染的預防
為了減少超感染的發生，減少病毒重組産生新的變異株以及由于重組帶來的治療失敗，可采取以下措施：
- 及早接受規範的抗逆轉錄病毒藥物治療。成功的抗病毒治療可以将病毒載量降低到檢測限以下，保持低病毒載量既可以防止将HIV傳播給他人，也可以保持自身有足夠的免疫防禦能力，防止二次HIV感染的發生。
- 在雙方都是HIV感染者的情況下，即使都接受了抗病毒治療，仍然強烈建議在發生性行為時使用安全套，以減少超感染發生機率。
- 拒絕毒品。任何情況下，都不要共用注射器。