自漢以來，民間即有祭祀扁鵲之俗，扁鵲由一介布衣，上升為受百姓膜拜的神人。 至宋代，宋仁宗封扁鵲為神應侯、神應公，為其築廟，太醫局将其作為醫學行業主祀之神，以岐伯從祀；南遷之後，宋高宗等于臨安府依在京舊制修建神應王廟。 金代部分醫生沿襲尊扁鵲的習俗。 迨至元代，官方以三皇為醫家之祖，以十大名醫從祀，其中無扁鵲。 明初沿襲元代之制，明嘉靖年間，曾從祀的１８ 位名醫，扁鵲位列其中。 關于先醫祭祀之禮，清代基本沿襲明制。 總之，明清時期扁鵲在太醫院祭祀先醫之祀中，失去主祀身份，被看成醫學的傳承者之一，降為從祀的地位。
扁鵲
司馬遷《史記· 扁鵲倉公列傳》記載了扁鵲治 愈許多危急的疾病，如治療虢太子假死之病，将魯公 扈與趙齊嬰２人的心互換。 扁鵲本是一介布衣，但 因其醫術高超，能治愈奇疾，故民間将其神化。 自漢 代始，民間即有為其立像祭祀者，且其地位不斷上升，宋代以前，扁鵲有被百姓稱王的記載。 王鄂撰寫 《國朝重修鵲山神應王廟》碑文記載：扁鵲廟，“五季之亂，數經殘圮。 周顯德中，安國軍節度使陳思讓為 重修之。 是時碑刻，已有稱王，未知封自何代”。 從碑文可知，扁鵲在被宋代皇帝封王之前，已被稱王，但由何代何人所封，文獻缺如。 有專家推測，有 可能是百姓稱其為王，而不是皇帝加封，表達了百姓 對扁鵲的尊崇。
扁鵲研究醫學
扁鵲于宋代被朝廷奉為醫學行業之神，源于宋 仁宗的一場疾病。 宋景祐元年（１０３４），翰林醫學許 希治愈宋仁宗趙祯的疾病，宋仁宗應許希所請，将扁鵲封為神應侯，為其築廟祭祀，并于其旁興建太醫 局。 《續資治通鑒長編》卷１１５載：“始上不豫，侍醫 數進藥不效，人心憂恐。 魏國大長公主薦翰林醫學 許希，診曰：‘針心下包絡之間，可亟愈。’左右争言 不可。 諸黃門請身試之，無所害，遂以針進，上疾愈。 九月戊子，授希翰林醫官，仍賜绯衣、銀魚及器币。 希拜謝已，又西向拜。 帝問其故，對曰：‘扁鵲，臣師 也，今者非臣之功，殆臣師之賜，敢忘所師乎！’乃請 以所得金創扁鵲廟，為築廟于城西隅，封神應侯。
嘉祐八年（１０６３），宋仁宗５３歲時，進一步冊封扁鵲為神應公。 之是以加封扁鵲，是因仁宗患病久 治不愈，故征召醫術知名的郓州觀察推官孫兆、邠州 司戶參軍單骧禦前診脈，對診治不力的醫官宋安道降罪，同時加封扁鵲。 仁宗皇帝當時想到了２９年前，曾護佑他的神醫 扁鵲，是以，此次亦想借助神力，故加封其為神應公。 《宋史· 職官志三》載：“列爵九等：曰王，曰郡王，曰 國公，曰 郡 公，曰 縣 公，曰 侯，曰 伯，曰 子，曰 男。”人間的封爵有等級之分，被皇帝冊封的神 靈也是有等次之分，仁宗皇帝期望通過對扁鵲進一 步加封來達到愈疾的目的。
宋仁宗畫像
俗語雲：有病亂投醫。為了愈疾，仁宗皇帝還冊封過道教神仙。 他曾夢見 ３位神人自言其姓号，像衛士一樣翊衛在他周圍，醒 後，疾病症狀減輕，遍求神祠而未找到這３位神仙， 後得于其所受箓中，故“加号上仙隐影唐将軍曰道 化真君、上靈飛形葛将軍曰護正真君、直使飛真周将 軍曰定志真君，仍于在京宮觀營建殿宇”。 遺憾的是，這些措施均未奏效，“辛未晦，上暴 崩于福甯殿。
南遷之後，南宋皇帝仍舊将扁鵲視為官方祭祀 的醫學行業神。 宋高宗時期，于臨安府太醫局内奉 祀神應王，同時祀岐伯。 《宋會要輯稿》載紹興十七 年（１１４７），臨安府扁鵲祠建神應王廟。 其載曰：“神 應王廟。 廟在兩浙路臨安府扁鵲祠。 高宗皇帝紹興 十七年，别建太醫局于臨安府，依在京舊制修建殿 宇。 十八年畢工，奉神像于殿，并奉善濟公（即歧伯 也）于東庑。”《宋會要輯稿》載宋光宗紹熙四年 （１１９３）九月二日，诏“太醫局奉安神應王善濟公，每遇春秋二祭，太常寺差官行事。 并九月九日神應王生日，令臨安府支錢二百貫文，充祠祭、齋醮使用，逐年準此”。
扁鵲行醫
宋理宗時重建太醫局，并由理宗皇 帝親書匾額“神應”。 《鹹淳臨安志》卷１２ 載：太醫 局“至紹定間重建。 殿曰‘神應’，奉醫師神應王，以 岐伯善濟公配。 講堂曰正紀，皆理宗皇帝禦書 扁”。 《夢梁錄》載：“醫學，在通江橋北，又名太醫 局，建殿扁曰‘神應’，奉醫師神應王，以岐伯善濟公 配祀。”值得注意的是，南宋時扁鵲已成為神應王，但其何時被那位皇帝封于為王，未見明确記載。 總之，扁鵲自漢代被神化，至宋代被皇帝封為王，且被朝廷作為醫學行業之神于太醫局祭祀。
考之《金史》，未見太醫院祭祀扁鵲的記載。 但金代統治者并非漢人，對中原 文化不是很熟悉，且金人吸收中原文化需要一定的 時間。 扁鵲作為醫學行業之神， 金朝統治者并不熟悉，顯然也沒有興趣祭拜。 但金朝統治下的部分醫生仍然尊崇神應王扁鵲。
迨至元代，元統治者以少數民族入主中原，對中 原文化亦不甚熟悉。 元朝統治者在醫學行業之祖的 祭祀方面有了新的政策。 元世祖忽必烈至元九年 （１２７２），诏随路設立醫學；至元二十三年（１２８６），令 諸路建立醫學三皇廟，祭祀伏羲、神農、黃帝，每路、 州、縣依儒學例，各設教官掌誨醫生。 以醫為業者， 每月初一、十五均需至三皇廟祭拜并讨論醫學，《元 典章》卷９曰：“各路并州縣，除醫學生員外，應用系 隸籍醫戶，及但有行醫之家，皆是醫業為生，拟合依 上，每月朔望去本處官聚集，三皇廟聖前焚香。
扁鵲治病行醫
元代從祀的十大名醫，《明集禮》卷１６ 載：“元以俞 跗、桐君、僦貸季、少師、雷公、鬼臾區、伯高、岐伯、少 俞、高陽十大名醫從祀，國朝因之。”該書始撰于 洪武二年（１３６９），洪武三年（１３７０）書成，其時離元朝滅亡不久，其所載從祀十大名醫之名應與元代相 同樣可信。 由上可知，扁鵲并不在元代中央政府所 定從祀的十大名醫之中。 總之，元代皇帝将三皇定為醫學之祖，并下令由郡縣官方通祀三皇，由黃帝時的臣子俞跗等十人從祀，此為元代新制。
在醫學之祖的祭祀方面，明朝初年承襲元制。 明朝建立之初，仍沿襲元制，郡縣通 祀三皇。 十大名醫從祀，其中無扁鵲。 以上情形自 嘉靖年間有所改變。 明嘉靖年間，從祀的名醫增加 了１０餘位，其中有扁鵲，但他失去主祀的身份，被朝庭降為從祀，成為醫學的傳承者之一。 洪武四年 （１３７１），朱元璋認為以醫藥祀三皇是亵祀，令天下 郡縣停止祭祀，僅在三皇陵寝祭祀，恢複官方對三皇 以帝王身份進行祭祀。 顧颉剛先生雲：“把三皇和 其他先代帝王同等待遇，不另立廟，隻祭于陵寝，可 算是一件合理的舉動。 但世宗嘉靖年間又建三皇廟 于太醫院了。”實際上，至永樂皇帝朱棣，已經改 弦更張，更改了其父朱元璋的主張，不僅在京師建三皇廟，且以十大名醫從祀。
扁鵲廟
嘉靖二十一年（１５４２）十 二月，重修太醫院三皇廟，仍祭十大名醫，且增加了 １８位名醫。 增加的１８位名醫， 其中包含扁鵲，處于從祀的地位。 “複增伊尹、神應王扁鵲、倉公淳于意、張機、華佗、王叔和、皇甫谧、抱 樸子葛洪、巢元方、真人孫思邈、藥王韋慈藏、啟玄子 王冰、錢乙、朱肱、劉完素、張元素、李杲、朱彥修十八 人。”加之前所述十大名醫，共２８位名醫，分列東西兩庑，每年仲春、仲冬上甲日，遣禮部堂上官行禮。
總之，自漢以來，扁鵲被神化，被民間百姓立像 供奉、祭祀，享受民間膜拜。 至宋代，扁鵲被皇帝封 為王，且被太醫局以醫學行業之神的身份配享主祀， 以岐伯從祀。 元代官方做了更改，将三皇做為醫祖祭祀，從祀的十大名醫中亦無扁鵲。 明清時期扁鵲成為太醫院祭祀先醫之禮中從祀的２８位名醫之一， 被看成是醫學的傳承者。