同安縣失守之後，鄭成功在接下來的時間裡都窩在銅山，除了派人四處購買糧食之外，并沒有什麼太大的作為，直到永曆三年的九月。
鄭成功在等待時機。
清廷雲霄守備張國柱最早是劉澤清的部将，劉澤清部瓦解之後，又投奔魯監國，魯監國政權崩潰之後，張國柱投降了清朝擔任副将。雲霄在明代屬于漳浦縣管轄， ，地位相當重要“雲霄一城處于閩廣交錯之地，乃士商往來貿易之所，雖非縣城可比，然為漳郡咽喉，全閩門戶，且逼鄰海濱，誠要區也”清廷派遣張國柱把守此地。
明軍。
張國柱擔任雲霄守備之後，貪婪無度，而且“禦兵無恩，率屬無禮”，部下千總王起俸十分厭惡他，在1648年的九月初三，王起俸帶領幾名親信偷偷跑到銅山，向鄭成功投降，鄭成功授其都督同知，又賜花紋銀五百兩、彩傘、玉帶、靴帽等物。十月初，明軍以王起俸為向導向雲霄進發，十月初十日，明軍自白塔登岸，分三路進兵，參戰将領有左先鋒施郎、援剿左鎮黃延、前沖鎮阮引、正兵營盧爵、右先鋒楊才、援剿右鎮黃山、後沖鎮周瑞、左沖鎮林義、右沖鎮洪習山，鄭成功親自帶領戎旗中軍康明、中沖鎮柯宸樞、親丁鎮張進為中軍，明軍參戰兵力按照清方在事後的報告為“萬餘”。
明末騎士。
張國柱本人的兵力按照明方史料《先王實錄》的說法“（十月初十）是午，雲霄守備張國柱、千總夏義、柯虎督馬步兵千餘，離城五裡，列陣迎戰”出城迎戰的清軍不過馬步兵千餘人，是以由此可見，整個雲霄鎮也未必就有多少清軍，以明代的标準，一個守備手下的官兵不會超過3000人，是以，即使清方報告中明軍的“萬餘人”有所誇大，明軍的真實數字那相比于雲霄守軍恐怕也要多了兩倍不止。
清軍兵力稀少。
是以其實按正常人的思路，這時候就應該像此戰過後閩浙總督陳錦的報告中所寫的那樣“理應固守城垣，飛報漳州以待援剿，蟻賊雖衆，何難内外夾攻而大殲之”憑借城牆固守，等待漳州而來的援軍，内外夾擊，擊破鄭成功。但張國柱張守備大概是自信過了頭，當然也有可能是因為“王起俸帶賊沖鋒以為前導，直至雲霄城下勒馬叫罵”。身着重甲領兵千餘人就敢出城迎擊，正逢左先鋒施琅之兵，清軍作戰失利，與施琅部将施顯隻一個照面，就施顯砍傷，張國柱畢竟身穿重甲，是以并未緻命，但此時明軍已如排山倒海一般沖殺而來，千餘名清軍迅速潰敗，張國柱由于甲胄過程在逃跑的過程中落水淹死。
明軍獲得了一次較大的勝利。
守衛雲霄城的張國柱旗鼓中軍姚國泰，見張國柱戰敗，就趕快關閉城門，然而，為時已晚，鄭成功指揮的明軍主力已經壓上來了，隻一天就将雲霄攻克，城内清軍潰亡殆盡，姚國泰身中數槍，被鄭軍俘獲，鄭成功命人醫治，傷愈之後，姚國泰便加入明軍，直到1657年的鄭成功北伐，此人在鄭成功部明軍中依舊身居要職。
張國柱部清軍确實有些自不量力。
功克雲霄之後，鄭成功準備接下來攻打诏安縣，派遣中沖鎮柯宸樞守衛盤陀嶺，防備漳州而來的清軍，鄭成功本人于10月20日領明軍主力自雲霄鎮啟程，準備攻打诏安縣。到10月26日，鄭成功紮營于龍峰、磁竈一帶，29日開始攻打诏安縣城，當地守将戰後報告說“十月二十九日，水陸逆賊數萬來攻縣城，各山紮營二十餘處，職督兵剿殺，陣斬甚多，生擒數賊當陣斬訖。三十日，賊衆複來攻城，職分兵出剿，殺賊不計，奪獲賊船二隻，打壞賊船數隻，傷賊無算，炮火數門俱棄水内。十一月初一日複來攻城，職設伏以待，賊屢犯屢敗，計窮莫支，方行逃遁”可見，攻打诏安的戰鬥并不算太順利。
鄭軍此時仍然沒有完全成長起來。
在10月26号鄭成功逼近诏安的同時，王之綱、王邦俊、赫文興、魏标、謝子連等部清軍已經逼近盤陀嶺，清軍“分作四股來犯:一股沖劫嶺門; 一股由右敵左援、右沖二鎮;一股由左敵中沖鎮;一股由中路截我往來應援。另 以海澄守虜赫文興一股從山下爬上，抄出中沖鎮之後。”
明末盔甲。
10月28日，清軍趁着大霧發動總攻，先沖破了援剿左、右沖二鎮，然後合力攻打柯宸樞，柯宸樞以及其弟中軍柯宸梅力戰不支，兄弟二人一同陣亡，盤陀嶺失守，雲霄鎮明軍被迫撤退，雲霄鎮再度淪入敵手，鄭成功在诏安聽聞敗訊，沒有追究戰敗之責任，而是撫恤柯宸樞的家人，随後便放棄了攻打诏安縣的計劃，又撤回海上。