吴三桂是一个颇具争议的人物，他先是“冲冠一怒为红颜”，引清兵入关，成为千古罪人；后又在西南追杀南明永历皇帝，被清朝封为“平西王”；最后又发动“三藩之乱”，最终被康熙平定。因此，吴三桂是明代两代都不得认可的人物。“三藩之乱”被平定后，清军全面清剿了吴三桂后代。
吴三桂有两个儿子，分别是吴应熊和吴应麒。关于吴应熊，史料记载十分清楚。反清前夕，吴三桂曾派密使到京，准备接回儿子。不料吴应熊不肯回昆明，故而吴应熊和次子吴世琳均被康熙诛杀。而吴应熊的嫡长子吴世璠在吴三桂死后继位，后兵败身亡。因此吴应熊这一支全部灭亡。吴三桂的另一儿子吴应麒，也是知名人物。吴三桂在世时，吴应麒领转战贵州、广西、湖南、四川。吴三桂死后，吴应麒退守昆明，而后《东华录》、《清史稿》等史籍上再没有关于吴应麒的记录。
清廷关于吴氏家族斩尽杀绝的圣旨，通令全国，然而吴应麒的去向成为了一个谜团。
而根据最近几十年的探访发现，吴三桂的后代居然隐居在了贵州省黔东南州岑巩县的一个小村庄——马家寨。马家寨以岩下河东西山脊为界，全寨230多户人家，人口大约2000人，全都姓吴，全寨人都会说江苏高邮话（吴三桂祖籍地）。这个秘密是怎么发现的呢？70年代，贵州历史学者黄透松被下放到岑巩县，在一次闲聊中，他无意中听到说“马家寨的人跟吴三桂有关系。”对历史有深入研究的黄透松深刻下了这句话。同时黄透松也注意到马家寨的建筑大多为江南风格的四合院。1983年，省文化厅下发文件，要求各地编写《中国历代名人名胜录》，其中有吴三桂。黄透松得知后决定再前往马家寨考查下，可他来回跑了三次，终于才有了收获。
1983年8月14日，黄透松找到了吴氏秘传人吴永松。吴永松先带着黄透松，来到马家寨背面山凸上，参观一座很不起眼的墓。并告诉黄透松这是陈圆圆之墓，墓碑内容如下：“
故先妣吴门聂氏之墓位席。孝男：吴启华。媳：涂氏。孝孙男：仕龙、仕杰。杨氏。曾孙：大经、大纯……皇清雍正六年岁次戊申仲冬月吉日立。
“故先妣”，没用清字，表明她是明末的吴氏先人；“妣”代表女性；“吴门”二字暗指老太婆是苏州人氏，“吴门”，即今苏州之别称，对外也可解释为吴家；“聂”用的是雍正年间还没有的简化字，是吴家为隐蔽起见创造的一个符号。陈圆圆本姓邢，后跟养父姓陈。邢有右耳，陈有左耳，“双耳”代表邢和陈，一字双意；“双”字的繁体是“雙”，上边两个“佳”字，佳佳为好，花好月圆，暗喻“圆圆”。“位席”显示她地位的崇高，以女性而位居宗祠，暗指“皇妃”之墓。十一个字连起来正好就是“周苏州氏陈圆圆皇妃之墓”。墓碑是“清雍正六年”所立，于是陈圆圆之墓被确定。
2010年7月11日上午，5名权威清史专家赶到了岑巩，并深入马家寨调查。后来，包括这5名权威清史在内的30多位清史专家再次来到马家寨，揭秘一桩历史谜案。专家冒雨赶到马家寨，并立即进行了深入全面的考察。专家们来到了马家寨男坟墓群中，找到了吴三桂儿子吴启华（吴应麒），孙子吴世（仕）龙的坟墓以及大将马宝的衣冠冢，并认真对碑文记载的内容进行了考察。在对村民家中的神龛进行考察时，专家们发现，所有的村民家的神龛，均出现了“延陵堂”等字样。
明清史学者李治亭教授联想到了吴三桂的别号，他惊讶地说：“吴三桂的别号就是‘延陵将军’呀，这太吻合了！”
那么吴三桂后人为什么要选择隐居在贵州的岑巩县呢？明清时期的岑巩是思州，为黔东地区的经济文化中心。当时吴三桂的挚友郑逢元是思州府平溪卫(今岑巩县大有镇茂隆村)人。明朝灭亡后，吴三桂多次劝郑逢元出仕清朝，被坚决拒绝。另外，吴三桂的心腹李敷治当时任思州知府。极有可能在两人的暗中帮助之下，使得吴三桂的后人安全隐居在了思州。
在考察中，一个问题始终让专家学者们百思不得其解，那就是马家寨名为“马家寨”但为何寨中的没有一人姓马呢？在专家们与吴氏密传人以及其他村民举行交谈时得知，当年陈老太婆（马家寨人对陈圆圆的尊称）和吴启华是由马宝护送到马家寨的，为了纪念马宝的恩德，让世代子孙都知晓，故把村寨名取为了“马家寨”。专家们在察看马宝的衣冠冢时发现墓碑上有“重垒土莹人祖即己祖，复修石台若翁如吾翁”的“感恩”说法。
吴永鹏自称自己家中有一本秘传家史《御字簿》，也就族谱。起初之时，村中还有秘传的“皇伞”，结果因为家境贫寒被拿来当被子盖而毁了，见过的人没几个。当地的金杯银筷也被拿到野牛山的亲友家收藏而失，然而也被偷卖了，至于最后仅存的两把大刀，一把96公斤，一把80公斤（实称12公斤），刀把上有绣球，同样也因贫穷被当做废铁给卖了一把。经过专家的调查之后，马家寨的村民的确是吴三桂的后裔。
不管如何，吴三桂的罪过和他的后代是没有关系的。我们可以唾骂吴三桂，但是没有必要口诛笔伐其后人，毕竟是后人是无辜的。现在的马家寨已经成为了一个乡村旅游地。