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塞浦路斯现“德尔塔克戎”毒株,是技术性错误吗?

近日,塞浦路斯大学生物科学教授、生物技术和分子病毒学实验室负责人考斯特里基斯(Leondios Kostrikis)称,在塞浦路斯发现了一种新型的结合了德尔塔毒株和奥密克戎毒株的新冠病毒菌株。

消息传出后,有科学家推测,这一发现是实验室污染导致的。当地时间1月9日,考斯特里基斯回应称,他所发现的情况显示的是“早期菌株(ancestral strain)受到一种进化压力而发生了变异,而不是单一重组事件的结果”。

不过,据美媒报道,塞浦路斯卫生部长哈吉潘特拉斯(Michael Hadjipantela)在1月9日表示,新毒株并不令人担忧。更多的细节将在本周的新闻发布会上公布。

塞浦路斯现“德尔塔克戎”毒株,是技术性错误吗?

该科学家:不是技术性错误

1月7日,考斯特里基斯称,他们在德尔塔毒株的基因组中发现了类似奥密克戎毒株的遗传特征。他认为这一新冠病毒菌株是德尔塔毒株和奥密克戎毒株的结合体,并将其命名为“德尔塔克戎”(deltacron)毒株。

据塞浦路斯当地媒体报道,在塞浦路斯采集的25份样本中发现了德尔塔克戎毒株,其中11份来自住院患者,14份来自普通公众。这25个病例的序列已于1月7日被送往追踪新冠病毒变化的全球共享流感数据倡议组织(GISAID)。

对于“实验室污染”假说,考斯特里基斯反驳称,与非住院病人相比,因新冠感染而住院的病人中,德尔塔克戎毒株的感染率更高。更重要的是,这些样本是在不止一个国家或地区的多个测序程序中处理的。他说,不止有一个存放在全球数据库中的、来自以色列的序列表现出德尔塔克戎毒株的遗传特征。

考斯特里基斯说:“这些发现反驳了那些无事实证明的说法,即德尔塔克戎是一个技术性错误的结果。”他认为,现在判断该毒株可能产生的影响还为时过早。他说:“我们将在未来看到这个毒株是否更具有病理性或更具有传染性,或者它是否会胜过德尔塔和奥密克戎”。但他认为,这一毒株最终会被高传染性的奥密克戎毒株所取代。

重组在新冠病毒中很常见

据英国媒体报道,2021年12月,莫德纳(Moderna)公司首席医疗官伯尔顿(Paul Burton)告诉英国下议院,德尔塔和奥密克戎毒株的共存增加了新变体的机会,因为它们可以交换基因。据美国媒体报道,这种重组在新冠病毒中很常见。一些研究表明,重组可能导致病毒以“危险的方式”变化,但也有助于研究人员开发治疗该病毒的药物。

英格兰伯明翰大学研究冠状病毒的微生物基因组学教授罗曼(Nick Loman)说,当一种病原体有多个变体在传播时,就会出现病毒的重组形式。他说,虽然德尔塔和奥密克戎的重组形式并不完全令人惊讶,但塞浦路斯的发现更可能是在对病毒基因组进行测序过程中出现的“技术性的人工制造”(technical artifact)。

英国帝国理工大学传染病部门病毒学家皮考克(Tom Peacock)说,几家塞浦路斯媒体报道的德尔塔克戎毒株看起来是“相当明显的污染”,因为“它们在进化树上没有聚类,并且在德尔塔毒株架构上有整个奥密克戎毒株的ARTIC引物测序扩增子。”

皮考克说,由于德尔塔毒株中的72号扩增子的拾取能力很差,“任何污染,即使是微不足道的污染,也会被优先扩增,最终你得到的就是一个混合序列”。

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