首先是他们的叶片，轮叶黑藻为5片，而伊乐藻为3片，第二，轮叶黑藻的叶片上会有一些小的锯齿，而伊乐藻没有这个特点，最后轮叶黑藻耐高温不宜腐坏水质，而伊乐藻不耐高温，对水质会造成一定的影响。
轮叶黑藻和伊乐藻的区别
轮叶黑藻是多年生的沉水植物，根茎比较细长，大概为50~80厘米，而伊乐藻虽然也是一种优质而又高产的沉水植物，但他们还是有一定量的区别的，首先是他们的叶片，轮叶黑藻为5片，而伊乐藻为3片。
第二种则是，轮叶黑藻的叶片上会有一些小的锯齿，而伊乐藻没有这个特点，因为两种沉水植物的形状和大小样式甚至于他们的生长高度和宽度都大致一样，所以不注意观察的话会很难发现这个小的细节问题。
最后一种的则是利用两种植物的耐温和水质环境污染进行区分的，在这方面轮叶黑藻属于耐高温，不会造成水质污染的，而伊乐藻则是不耐高温，同时也会对水质也会造成一定的污染的。
伊乐藻
目前来说，要区分轮叶黑藻和伊乐藻区别，多是使用这三种方式，除非是用作别的用途，不然这两种植物的作用和效果区别都不是很大，它们都可以用作于小龙虾养植所食用的饵料和水草种植品种。