巴基斯坦鲸的体型较小而细瘦，外形很像一只狗或者长腿的老鼠，和现代的鲸类根本没有多少相似之处，它的眼睛位于头顶，耳中具有耳鼓，但是鼓泡相当致密，鼻孔已经从鼻尖开始向头顶移动，形态几乎是现代鲸类呼吸孔的雏形，它的四肢比较纤细，脚踝处有和偶蹄类动物相似的构造。巴基斯坦鲸属于肉食动物，善于在地面上奔跑，它们主要生活在陆地上，特别是河湖沼泽附近，但是已经具有一些适应水中生活的特征，比如耳朵内相当致密的鼓泡可以通过稠密的海水将声音传入耳内，因此可能有些时间会在水中生活。
为什么说巴基斯坦鲸是鲸类的祖先
巴基斯坦鲸的化石最早发现在20世纪70年代，但是当时只是两件骨盆化石，后来随着发现化石不断增多，到了21世纪才发现，将这些化石拼凑在一起的结果竟然是一只能在陆地上行走的鲸，从而轰动了全世界，开始人们推断巴基斯坦鲸是水陆两栖生活的，但是后来发现它们更适合在陆地上生活，不过巴基斯坦鲸仍保存了类似陆栖哺乳类，在水下毫无作用的耳鼓，但是鼓泡已经朝着现代鲸的方向进化，表现出连接陆地动物和鲸的中间物种的形态，使得人类离揭开鲸进入海洋的真相又进了一步。
不过既然是鲸鱼的祖先，那么这种动物最让人关注的，也就是它究竟是何时下海？首先巴基斯坦这一地区，作为鲸鱼走下大海的起始点，还是颇为有利，因为巴基斯坦在始新世时期，有着大片的临海地区，并且气候湿润，可以说至少在气候环境方面，有着得天独厚的优势。但即使如此，巴基鲸究竟是两栖动物，还是完全的陆生动物，这一点却还是存在极大的争议。持陆生动物观点的学者，认为巴基鲸的骨骼化石结构，过于类似中爪兽目的动物，毕竟用现代动物参照，也没有哪一个两栖哺乳动物，有着和巴基鲸一样健硕的四肢。
而认为巴基鲸是水陆两栖一派，其根据自然也是巴基鲸的化石。巴基鲸的整个背部相对平滑，而且它的鼻孔，类似于鳄鱼那样，都位于头部上方，同时它的听力和视觉，根据化石的结构来看，也更加适应从下方感知高处的猎物。换句话说，巴基鲸身体结构，除了它们那修长的四肢，其他是完全可以做到和鳄鱼一样在水中伏击狩猎。
总的来说，巴基鲸算得上是鲸类走向大海的第一步，虽然这个动物看起来相貌丑陋，但是从今天庞大的鲸类家族来看，巴基鲸无疑给它们的后代留下了一个成功的开始。当巴基鲸最后在历史上彻底消逝之时，地球历史，将很快迎来一群新的深海巨兽，以及一段新的进化史诗。