前言：
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一、系统架构：
二、时钟树：
- STM32 有5个时钟源:HSI、HSE、LSI、LSE、PLL。
①、HSI是高速内部时钟，RC振荡器，频率为8MHz，精度不高。
②、HSE是高速外部时钟，可接石英/陶瓷谐振器，或者接外部时钟源，频率范围为4MHz~16MHz。
③、LSI是低速内部时钟，RC振荡器，频率为40kHz，提供低功耗时钟。
④、LSE是低速外部时钟，接频率为32.768kHz的石英晶体。
⑤、PLL为锁相环倍频输出，其时钟输入源可选择为HSI/2、HSE或者HSE/2。 倍频可选择为2~16倍，但是其输出频率最大不得超过72MHz。
2. 系统时钟SYSCLK可来源于三个时钟源：
①、HSI振荡器时钟
②、HSE振荡器时钟
③、PLL时钟
3.STM32可以选择一个时钟信号输出到MCO脚(PA8)上，可以选择为PLL 输出的2分频、HSI、HSE、或者系统时钟。这个时钟可以用来给外部其他系统提供时钟源。
用户可通过多个预分频器配置AHB总线、高速APB2总线和低速APB1总线的频率。AHB和APB2域的最大频率是72MHZ。APB1域的最大允许频率是36MHZ。SDIO接口的时钟频率固定为HCLK/2。
4.系统时钟SYSCLK
它是供STM32中绝大部分部件工作的时钟源，它可选择为PLL输出、HSI或者HSE，（一般程序中采用PLL倍频到72Mhz）在选择时钟源前注意要判断目标时钟源是否已经稳定振荡。Max=72MHz，它分为2路，1路送给I2S2、I2S3使用的I2S2CLK,I2S3CLK；另外1路通过AHB分频器分频（1/2/4/8/16/64/128/256/512）分频后送给以下8大模块使用：
①送给SDIO使用的SDIOCLK时钟。
②送给FSMC使用的FSMCCLK时钟。
③送给AHB总线、内核、内存和DMA使用的HCLK时钟。
④通过8分频后送给Cortex的系统定时器时钟（SysTick）。
⑤直接送给Cortex的空闲运行时钟FCLK。
⑥送给APB1分频器。APB1分频器可选择1、2、4、8、16分频，其输出一路供APB1外设使用(PCLK1，最大频率36MHz)，另一路送给定时器(Timer2-7)2、3、4倍频器使用。该倍频器可选择1或者2倍频，时钟输出供定时器2、3、4、5、6、7使用。
⑦送给APB2分频器。APB2分频器可选择1、2、4、8、16分频，其输出一路供APB2外设使用(PCLK2，最大频率72MHz)，另一路送给定时器(Timer1、Timer8)1、2倍频器使用。该倍频器可选择1或者2倍频，时钟输出供定时器1和定时器8使用。另外，APB2分频器还有一路输出供ADC分频器使用，分频后得到ADCCLK时钟送给ADC模块使用。ADC分频器可选择为2、4、6、8分频。
⑧2分频后送给SDIO AHB接口使用（HCLK/2）。
5.时钟输出的使能控制
在以上的时钟输出中有很多是带使能控制的，如AHB总线时钟、内核时钟、各种APB1外设、APB2外设等。当需要使用某模块时，必需先使能对应的时钟。需要注意的是定时器的倍频器，当APB的分频为1时，它的倍频值为1，否则它的倍频值就为2。
连接在APB1(低速外设)上的设备有：电源接口、备份接口、CAN、USB、I2C1、I2C2、UART2、UART3、SPI2、窗口看门狗、 Timer2、Timer3、Timer4。注意USB模块虽然需要一个单独的48MHz时钟信号，但它应该不是供USB模块工作的时钟，而只是提供给串行接口引擎(SIE)使用的时钟。USB模块工作的时钟应该是由APB1提供的。
连接在APB2(高速外设)上的设备有：GPIO_A-E、USART1、ADC1、ADC2、ADC3、TIM1、TIM8、SPI1、AFIO；
6.重新配置系统时钟源以及时钟
void RCC_PLL_Configuration(void)
{
RCC_DeInit(); /*将外设RCC寄存器重设为缺省值 */
RCC_HSEConfig(RCC_HSE_ON); /*设置外部高速晶振（HSE） HSE晶振打开(ON)*/
if(RCC_WaitForHSEStartUp() == SUCCESS) { /*等待HSE起振, SUCCESS：HSE晶振稳定且就绪*/
RCC_HCLKConfig(RCC_SYSCLK_Div1); /*设置AHB时钟（HCLK） RCC_SYSCLK_Div1——AHB时钟 = 系统时*/
RCC_PCLK2Config(RCC_HCLK_Div1); /* 设置高速AHB时钟（PCLK2)RCC_HCLK_Div1——APB2时钟 = HCLK*/
RCC_PCLK1Config(RCC_HCLK_Div2); /*设置低速AHB时钟（PCLK1）RCC_HCLK_Div2——APB1时钟 = HCLK / 2*/
FLASH_SetLatency(FLASH_Latency_2); /*设置FLASH存储器延时时钟周期数FLASH_Latency_2 2延时周期*/
FLASH_PrefetchBufferCmd(FLASH_PrefetchBuffer_Enable); /*选择FLASH预取指缓存的模,预取指缓存使能*/
RCC_PLLConfig(RCC_PLLSource_HSE_Div2, RCC_PLLMul_3);/*设置PLL时钟源及倍频系数*/
RCC_PLLCmd(ENABLE); /*使能PLL */
while(RCC_GetFlagStatus(RCC_FLAG_PLLRDY) == RESET) ; /*检查指定的RCC标志位(PLL准备好标志)设置与否*/
RCC_SYSCLKConfig(RCC_SYSCLKSource_PLLCLK); /*设置系统时钟（SYSCLK） */
while(RCC_GetSYSCLKSource() != 0x08); /*0x08：PLL作为系统时钟 */
}
}
参考：
1.STM32中文参考手册_V10
2.STM32的时钟系统
3.关于STM32时钟系统
4. STM32 时钟系统