时钟是单片机的心脏，重要性不言而喻，STM32F4的时钟树是比较复杂的，所以不是一言两语能写清楚的，我只简单的描述下时钟来源，详细知识需要去看正点原子的视频讲解。
整个时钟来源有五个：
1.LSI（Low Speed Interior）低速内部时钟，是由内部RC振荡器产生的不怎么精确的时钟，主要用来给看门狗提供时钟频率。看门狗的作用可以简单理解是为了防止程序跑飞了，就是检测是系统故障的一个功能。
2.LSE(Low Speed Exterior)低速外部时钟，是外接32MHz的晶振。主要是给RTC提供时钟频率。RTC是实时时钟，功能和定时器差不多。
3.HSI高速内部时钟，由RC振荡器产生。
4.HSE高速外部时钟，由外接晶振产生，频率在4-26MHz之内。
5.PLLCLK（Phase Loked Loop）锁相环时钟，至于锁相环是干嘛用的，百度讲的比我清楚：锁相环百科
那么为什么要这么多时钟源干嘛？主要还是为了降低功耗，因为好多外设并不需要那么高的频率。
系统时钟主要是由主PLL产生，如图
上面的为主PLL，时钟来源有HSI和HSE。一般选择来源是HSE外接4-26MHz的晶振，具体是多少要看板子的电路图，然后还要修改库函数里的默认的频率。系统时钟频率虽然说最高是168MHz，但是已经定死了默认是168MHz，不好修改。
所以有个公式SYSCLK=168=f/M*(N/P),f为PLL输出频率，M为HSI或HSE分频数，N和P为锁相环内部倍频和分频数，N为336，P为2。由于PLL时钟来源我们选择的是HSE，根据我们给的晶振来的，所以要在system_stm32f4xx.c文件里面只需要修改M的值为你的HSE晶振的值即可，一般为8MHz晶振所以M为8，这样sysclk=8M/8*(336/2)=168M。