同安县失守之后，郑成功在接下来的时间里都窝在铜山，除了派人四处购买粮食之外，并没有什么太大的作为，直到永历三年的九月。
郑成功在等待时机。
清廷云霄守备张国柱最早是刘泽清的部将，刘泽清部瓦解之后，又投奔鲁监国，鲁监国政权崩溃之后，张国柱投降了清朝担任副将。云霄在明代属于漳浦县管辖， ，地位相当重要“云霄一城处于闽广交错之地，乃士商往来贸易之所，虽非县城可比，然为漳郡咽喉，全闽门户，且逼邻海滨，诚要区也”清廷派遣张国柱把守此地。
明军。
张国柱担任云霄守备之后，贪婪无度，而且“御兵无恩，率属无礼”，部下千总王起俸十分厌恶他，在1648年的九月初三，王起俸带领几名亲信偷偷跑到铜山，向郑成功投降，郑成功授其都督同知，又赐花纹银五百两、彩伞、玉带、靴帽等物。十月初，明军以王起俸为向导向云霄进发，十月初十日，明军自白塔登岸，分三路进兵，参战将领有左先锋施郎、援剿左镇黄延、前冲镇阮引、正兵营卢爵、右先锋杨才、援剿右镇黄山、后冲镇周瑞、左冲镇林义、右冲镇洪习山，郑成功亲自带领戎旗中军康明、中冲镇柯宸枢、亲丁镇张进为中军，明军参战兵力按照清方在事后的报告为“万余”。
明末骑士。
张国柱本人的兵力按照明方史料《先王实录》的说法“（十月初十）是午，云霄守备张国柱、千总夏义、柯虎督马步兵千余，离城五里，列阵迎战”出城迎战的清军不过马步兵千余人，所以由此可见，整个云霄镇也未必就有多少清军，以明代的标准，一个守备手下的官兵不会超过3000人，所以，即使清方报告中明军的“万余人”有所夸大，明军的真实数字那相比于云霄守军恐怕也要多了两倍不止。
清军兵力稀少。
所以其实按正常人的思路，这时候就应该像此战过后闽浙总督陈锦的报告中所写的那样“理应固守城垣，飞报漳州以待援剿，蚁贼虽众，何难内外夹攻而大歼之”凭借城墙固守，等待漳州而来的援军，内外夹击，击破郑成功。但张国柱张守备大概是自信过了头，当然也有可能是因为“王起俸带贼冲锋以为前导，直至云霄城下勒马叫骂”。身着重甲领兵千余人就敢出城迎击，正逢左先锋施琅之兵，清军作战失利，与施琅部将施显只一个照面，就施显砍伤，张国柱毕竟身穿重甲，因此并未致命，但此时明军已如排山倒海一般冲杀而来，千余名清军迅速溃败，张国柱由于甲胄过程在逃跑的过程中落水淹死。
明军获得了一次较大的胜利。
守卫云霄城的张国柱旗鼓中军姚国泰，见张国柱战败，就赶快关闭城门，然而，为时已晚，郑成功指挥的明军主力已经压上来了，只一天就将云霄攻克，城内清军溃亡殆尽，姚国泰身中数枪，被郑军俘获，郑成功命人医治，伤愈之后，姚国泰便加入明军，直到1657年的郑成功北伐，此人在郑成功部明军中依旧身居要职。
张国柱部清军确实有些自不量力。
功克云霄之后，郑成功准备接下来攻打诏安县，派遣中冲镇柯宸枢守卫盘陀岭，防备漳州而来的清军，郑成功本人于10月20日领明军主力自云霄镇启程，准备攻打诏安县。到10月26日，郑成功扎营于龙峰、磁灶一带，29日开始攻打诏安县城，当地守将战后报告说“十月二十九日，水陆逆贼数万来攻县城，各山扎营二十余处，职督兵剿杀，阵斩甚多，生擒数贼当阵斩讫。三十日，贼众复来攻城，职分兵出剿，杀贼不计，夺获贼船二只，打坏贼船数只，伤贼无算，炮火数门俱弃水内。十一月初一日复来攻城，职设伏以待，贼屡犯屡败，计穷莫支，方行逃遁”可见，攻打诏安的战斗并不算太顺利。
郑军此时仍然没有完全成长起来。
在10月26号郑成功逼近诏安的同时，王之纲、王邦俊、赫文兴、魏标、谢子连等部清军已经逼近盘陀岭，清军“分作四股来犯:一股冲劫岭门; 一股由右敌左援、右冲二镇;一股由左敌中冲镇;一股由中路截我往来应援。另 以海澄守虏赫文兴一股从山下爬上，抄出中冲镇之后。”
明末盔甲。
10月28日，清军趁着大雾发动总攻，先冲破了援剿左、右冲二镇，然后合力攻打柯宸枢，柯宸枢以及其弟中军柯宸梅力战不支，兄弟二人一同阵亡，盘陀岭失守，云霄镇明军被迫撤退，云霄镇再度沦入敌手，郑成功在诏安听闻败讯，没有追究战败之责任，而是抚恤柯宸枢的家人，随后便放弃了攻打诏安县的计划，又撤回海上。